大连渤海潮间带沉积物中微生物群落结构多样性及其与环境因子的相互作用

目录

声明

1 绪论

1.1 海洋环境概况

1.2 渤海沿海环境概况

1.3 潮间带沉积物研究概况

1.4 海洋微生物与海洋微生物学

1.5 海洋微生物多样性研究技术

1.5.1 传统培养方法

1.5.2 传统非培养方法

1.5.3 现代高通量测序技术

1.6 生物信息学分析方法

1.6.1 物种分类学注释

1.6.2 物种组成分析

1.6.3 α多样性分析

1.6.4 β多样性分析

1.6.5 物种差异与标志物分析

1.6.6 关联网络分析

1.6.7 功能潜能预测的方法

1.7 本研究的目的与意义

2 材料与方法

2.1 微生物群落结构分析

2.1.1 材料与设备

2.1.2 样品采集与制备

2.1.3 环境样品基因组DNA的提取

2.1.4 目标片段PCR扩增

2.1.5 高通量测序

2.2 环境参数测定

2.2.1 总碳的测定

2.2.2 总氮的测定

2.2.3 总磷的测定

3 结果与讨论

3.1 微生物的组成

3.1.1 物种分类学注释

3.2 微生物的群落结构

3.2.1 Alpha多样性分析

3.2.2 β多样性分析

3.2.3 物种组成热图

3.3 微生物的空间分布情况

3.4 表层微生物与深层微生物的对比

3.5 总碳总氮总磷的测定

3.6 环境与微生物的关系

3.6.1 环境中的特殊微生物与环境的相互作用

3.6.2 特殊生境对于微生物群落结构的影响

结论

参考文献

致谢