重复序列Itf_1，Itf_2在甘薯核型分析中的应用与甘薯及其近缘野生种ITS序列鉴定

摘要

本研究选取与栽培种亲缘关系最近的，被公认为最有可能是甘薯祖先种的I.trifida（2x），采用二代测序、克隆、FISH等技术，对其重复序列进行了检出，并很好的运用于二倍体 I.trifida的核型标准化，鉴定了I.trifida（6x）与 I. batatas′Xushu18′的核型。另选用10份甘薯近缘野生种材料，通过对rDNA ITS序列的分析，鉴定了其与栽培种甘薯（Ipomoea batatas′Xushu18′）之间的亲缘关系。以上分析结果如下：　　1.通过杂交组合分析，筛选出了2个具有代表性的重复序列，并将其命名为Itf_1及Itf_2。两个序列在I.trifida（2x）上分别显示8对和4对信号，二者间有4个信号位于相同染色体上，Itf_1有1对信号与45S部分重叠，Itf_2与5S的1对信号部分重叠。　　2.Itf_1、45S、5S在I.trifida（2x），I.trifida（6x）与I. batatas′Xushu18′中的信号数目随着倍性增加而增加，六倍体信号数目为二倍体的3倍；Itf_2在二倍体上显示的信号为4对，在两个六倍体中却为12个，而不是三倍化的24个。　　3.Itf_1、Itf_1、45S与5S序列的定位很好的进行了I.trifida（2x）核型标准化及I.trifida（6x）与I. batatas′Xushu18′的核型分析，均绘制了模式图。核型比较结果显示了三者之间较近的亲缘关系。　　4.甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列长度在570-600bp之间，ITS1序列为185-209bp，其（G+ C）含量为53.11％-61.83%；ITS2序列为214-226bp，其（G+ C）含量为61.21%-72.89%；5.8S序列均为165bp，其（G+ C）含量为54.55%-55.76%；信息位点均集中在ITS1和ITS2上；　　5.系统进化分析表明，栽培种甘薯（I. batatas′Xushu18′）和野生种I. triloba、I. cordatotriloba、I. lacunosa、I. trifida的亲缘关系较近，与I. wrightii、I. pes-tigridis、I. grandifolia、I. nil、I. hederaceaJacq.、I. purpurea的亲缘关系较远；杂交后代与栽培种甘薯（I. batatas′Xushu18′）亲缘关系较近，与野生种父本I. hederaceaJacq.的亲缘关系较远。

目录

封面

声明

致谢

中文摘要

英文摘要

英文缩写词及中文对照表

目录

第一章 绪论

1.1甘薯遗传学背景

1.2亲缘关系的鉴定

1.3一般核型分析

1.4选题依据及意义

第二章 甘薯近缘野生种I.trifida（2x）重复序列检出

2.1实验材料与设备

2.2实验方法

2.3结果与分析

2.4讨论

第三章基于Itf_1、Itf_2及45S和5S rDNA对I.trifida （2x，6x）、I. batatas′Xushu18′的核型标准化

3.1实验材料与设备

3.2实验方法

3.3结果与分析

3.4讨论

第四章 甘薯及其近缘野生种ITS序列分析

4.1实验材料与仪器

4.2实验方法

4.3结果与分析

4.4讨论

图版及其说明

结论

参考文献

作者简历

学位论文数据集