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目录
第1章 引言
第2章 蛋白质二级质谱鉴定主流算法
2.1 基于关联匹配模型的Sequest算法
2.2 基于概率统计的匹配模型的ProVerB算法
2.3 随机匹配模型
2.4 FDR质量控制
第3章 基于正反库特征信息匹配的蛋白质二级质谱鉴定算法
3.1 MS/MS数据集
3.2 MS/MS数据集处理
3.3 MS/MS 数据库及仪器精度
3.4 理论图谱的产生
3.5 同位素峰合并
3.6 有效峰的选取
3.7 基于正反库特征信息的提取
3.7.1 训练集的提取
3.7.2 基于正反库匹配信息统计思想
3.7.3 统计结果的相关性
3.7.4 特征信息的数学定量
3.8 打分函数
3.8.1 碎片离子峰的匹配打分模型
3.8.2碎片峰连续匹配打分模型
3.8.3 b/y离子峰的匹配打分模型
3.8.4 肽段匹配总分值
3.9 PepFind鉴定结果
3.9.1 PepFind与主流算法软件Mascot,Sequest结果比较
3.9.2 PepFind基于FDR质量控制分析
3.9.3 PepFind算法的可靠性
3. 9. 4 多种蛋白质二级质谱鉴定算法搜索结果比较
第4章 总结与展望
参考文献
附录:PepFind软件统计主程序
在学位期间发表的学术成果
致谢
云南民族大学;