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可变剪切因子hnRNPL及组蛋白伴侣FACT复合物亚基SSRP1的结构生物学研究

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摘要

第一篇 可变剪切因子hnRNP-L的结构及与RNA结合特性的研究

第1章 综述

1.1 前体mRNA的剪切

1.2 可变剪切概述

1.3 HnRNP L蛋白研究现状

第2章 实验材料与方法

2.1 质粒构建,蛋白表达和纯化

2.2 HnRNP-L各部分蛋白的表达和纯化

2.3 HnRNP L RRM1和RRM34的晶体生长和衍射数据收集

2.4 模型构建和结构修正

2.5 凝胶迁移阻滞实验(EMSA)

2.6 表面等离子共振实验(SPR)

2.7 稳态FRET实验

2.8 等温滴定微量热实验(ITC)

2.9 Cross-link实验

2.10 动态光散射实验(DLS)

第3章 实验结果与讨论

3.1 HnRNP L各部分结合RNA的能力

3.2 HnRNP L RRM1和hnRNP L RRM34的结构解析

3.3 HnRNP L RRM1的结构

3.4 HnRNP L RRMN1的RNA结合面

3.5 HnRNP L RRM34的结构

3.6 HnRNP L RRM34和PTB RRM34的结构

3.7 HnRNP L RRM34的RNA结合面

3.8 HnRNP L RRM34诱导RNA成环

3.9 讨论

本篇小结

参考文献

第二篇 组蛋白伴侣SSRP1的结构与功能研究

第1章 转录延伸因子及组蛋白伴侣FACT复合物的研究进展

1.1 转录延伸因子概述

1.2 组蛋白伴侣FACT的研究进展

第2章 实验材料和方法

2.1 基因的克隆、质粒构建和蛋白表达

2.2 SSRP1蛋白的纯化

2.3 SSRP1-M蛋白的晶体生长和衍射数据收集

2.4 模型构建和结构修正

2.5 凝胶迁移阻滞实验(EMSA)

2.6 荧光偏振实验(FPA)

2.7 圆二色谱(CD)实验

2.8 SSRP1蛋白与组蛋白的结合实验

第3章 实验结果与讨论

3.1 SSRP1蛋白的表达、纯化与晶体生长

3.2 SSRP1-M蛋白的结构解析

3.3 SSRP1-M蛋白的整体结构

3.4 SSRP1-M蛋白与Pob3-M和Rtt106-M的结构比较

3.5 SSRP1-M与DNA的相互作用

3.7 SSRP1-M与组蛋白的结合实验

3.8 讨论

3.9 展望

本篇小结

参考文献

致谢

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