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【6h】

基于高通量测序筛选心房纤维化中差异表达的miRNA及mRNA

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声明

缩略语/符号说明

研究现状、成果

研究目的、方法

1.对象和方法

1.1实验动物

1.2建立慢性间歇缺氧大鼠模型

1.3心脏超声检查

1.4血流动力学检查

1.6病理染色

1.6.1制作组织病理切片

1.6.2苏木精-伊红染色(HE染色)

1.6.3马松染色(Masson染色)

1.6.4免疫组织化学染色(Immunohistochemistry,IHC)

1.7.1提取心房组织蛋白

1.7.2蛋白浓度测定

1.7.3蛋白免疫印迹实验

1.8高通量测序技术

1.8.1提取心房组织RNA

1.8.2 RNA浓度测定及质控

1.8.3 RNA逆转录

1.8.4 建立文库

1.8.5 Small RNA测序数据预处理

1.8.6 novel miRNA 预测

1.8.7 miRNA表达

1.8.8 miRNA差异分析

1.8.9差异miRNA的靶基因预测

1.8.10 mRNA表达及差异分析

1.9生物信息学分析

1.10 Real-Time PCR验证

1.11统计学方法

2.实验结果

2.1大鼠基线资料

2.2大鼠心脏超声数据

2.3大鼠血流动力学数据

2.4模型验证结果

2.4.1 HE染色

2.4.2 Masson染色

2.4.3 IHC染色

2.4.4 Western Blot实验

2.5 RNA浓度和质控结果

2.6测序结果

2.6.1 clean reads统计

2.6.2 small RNA 的分类注释

2.6.3 mRNA与miRNA的表达

2.6.4显著差异miRNA的表达分析

2.6.5显著差异miRNA的整体分布

2.6.6显著差异mRNA的筛选

2.6.7差异mRNA的整体分布

2.7聚类分析结果

2.7.1显著差异miRNA的聚类分析

2.7.2显著差异mRNA的聚类分析

2.8生物学信息分析结果

2.8.1显著差异miRNA生物学信息分析

2.8.2 显著差异mRNA生物学信息分析

2.8.2.4 wnt2b的KEGG富集分析

2.9 Real-Time PCR验证结果

3.讨论

3.1高通量测序技术

3.2心房纤维化与心血管疾病

3.3建立心房纤维化模型

3.4显著差异miRNA的表达

3.5显著差异mRNA的表达

3.6 Wnt信号通路可能参与了心房纤维化过程

3.7 miR-29可能通过抑制Wnt信号通路改善心房纤维化

结论

参考文献

综述:miRNA与心血管疾病

综述参考文献

致谢

个人简历

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著录项

  • 作者

    刘昭宏;

  • 作者单位

    天津医科大学;

  • 授予单位 天津医科大学;
  • 学科 临床医学(内科学心血管病)
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 刘恩照;
  • 年度 2020
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 R54R5;
  • 关键词

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