声明
主要符号及缩略表（Acronyms and Symbols）
引言
第一章 文献综述
1.1 果树盐胁迫研究进展
1.1.1盐胁迫对果树的影响
1.1.2果树耐盐生理研究
1.2 果树转录组研究进展
1.2.1转录组测序基本介绍
1.2.2转录组测序技术在果树中的应用
1.2.3盐胁迫下果树转录组研究进展
1.3 果树miRNA研究进展
1.3.1 miRNA作用
1.3.2果树相关miRNA的鉴定和研究
1.3.3盐胁迫下果树miRNA研究
第二章 基于转录组测序对NaCl胁迫下新疆野苹果叶片光合作用与激素信号转导相关基因分析
2.1材料与方法
2.1.1试验材料
2.1.2试验处理
2.1.3新疆野苹果叶片转录组测序及分析
2.1.4新疆野苹果叶片测序数据过滤和参考序列比对
2.1.6 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异基因qRT-PCR验证
2.2 结果与分析
2.2.1新疆野苹果叶片测序数据质量分析
2.2.2新疆野苹果叶片序列比对结果
2.2.3 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异基因的分析
2.2.5 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异表达基因的KEGG富集
2.2.6 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片与光合作用相关的差异基因
2.2.7 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片与植物激素信号转导相关的差异基因
2.2.8 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异基因qRT-PCR结果
2.3 讨论
2.3.1 NaCl胁迫对新疆野苹果叶片光合作用通路的影响
2.3.2 NaCl胁迫对新疆野苹果幼苗叶片植物激素信号转导通路的影响
2.4 小结
第三章 基于转录组测序对NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根糖酵解相关基因的分析
3.1材料与方法
3.1.1试验材料
3.1.2试验处理
3.1.3新疆野苹果叶和根转录组测序及分析
3.1.5 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根qRT-PCR验证
3.2 结果与分析
3.2.1新疆野苹果叶和根转录组测序数据质量分析
3.2.2新疆野苹果叶和根序列比对结果
3.2.3 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根差异基因的分析
3.2.5 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根差异表达基因的KEGG富集分析
3.2.6 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根与糖酵解及丙酮酸代谢相关的差异基因
3.2.7 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根差异基因qRT-PCR结果
3.3 讨论
3.4 小结
第四章 新疆野苹果幼苗叶片响应NaCl胁迫的miRNAs及靶基因筛选
4.1 材料与方法
4.1.1试验材料与处理
4.1.2新疆野苹果叶片sRNA文库构建及其数据分析
4.1.3 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异miRNAs表达分析及靶基因显著性富集分析
4.1.4 NaC1胁迫下新疆野苹果叶片差异miRNA与mRNA的反转录和qRT-PCR
4.2 结果与分析
4.2.1新疆野苹果叶片不同处理RNA质量检测
4.2.2疆野苹果叶片不同处理small RNA分类注释
4.2.3新疆野苹果叶片Clean Reads长度分布
4.2.4 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异miRNA及靶基因预测结果分析
4.2.5 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片miRNA的靶基因GO显著性富集分析
4.2.6 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片miRNA的靶基因KEGG显著性富集分析
4.2.7 NaCl胁迫下新疆野苹果叶片差异表达的miRNA及靶基因qRT-PCR验证
4.3 讨论
4.4 小结
第五章 新疆野苹果叶片及根系响应NaCl胁迫的miRNAs及靶基因筛选
5.1 材料与方法
5.1.1试验材料与处理
5.1.2新疆野苹果叶和根sRNA文库构建及其数据分析
5.1.3 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根差异miRNAs表达分析及靶基因显著性富集分析
5.2 结果与分析
5.2.1新疆野苹果叶和根不同处理RNA质量检测
5.2.2疆野苹果叶和根不同处理small RNA分类注释
5.2.3新疆野苹果叶和根Clean Reads长度分布
5.2.4 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根差异miRNA及靶基因预测结果分析
5.2.5 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根miRNA的靶基因GO显著性富集分析
5.2.6 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根miRNA的靶基因KEGG显著性富集分析
5.2.7 NaCl胁迫下新疆野苹果叶和根差异表达的miRNA及靶基因qRT-PCR验证
5.3 讨论
5.4 小结
第六章 全文结论
参考文献
致谢
作者简介
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表
石河子大学;
