声明
第一章 绪论
1.1研究背景及意义
1.2文献综述
1.2.1畜禽粪肥产生及利用现状
1.2.2畜禽粪肥施用对农田土壤环境因子的影响
1.2.3畜禽粪肥施用对农田土壤微生物群落的影响
1.2.4高通量测序技术土壤微生物学中的应用
1.3研究目的及内容
1.3.1研究目的
1.3.2研究内容
1.4技术路线
第二章 材料和方法
2.1实验样地概况
2.2实验设计
（1）畜禽粪肥选择及来源
（2）作物选择和种植
（3）田间实验设计
2.3土壤样品采集及分析方法
2.3.1土壤样品采集
2.3.2土壤与粪肥理化性质分析
2.3.3 土壤微生物分析
2.4土壤呼吸速率测定
2.5数据处理与统计分析
2.5.1描述性统计分析
2.5.2 Shannon和ACE指数
2.5.3微生物分析方法
第三章 典型粪肥理化性质及其微生物群落分析
3.1典型粪肥理化性质分析
3.1.1养分测定结果
3.2.2重金属测定结果
3.2典型粪肥微生物群落多样性分析
3.2.1样本测序结果
3.2.2微生物群落??多样性的
3.3典型粪肥微生物群落组成结构分析
3.3.1微生物群落主成分分析
3.3.2微生物群落门水平组成
3.3.3微生物属水平组成
第四章 典型粪肥施用对农田土壤微生物的影响
4.1典型粪肥施用对土壤环境因子的影响
4.1.1粪肥施用种类对土壤pH值的影响
4.1.2粪肥施用种类对土壤养分的影响
4.1.3粪肥施用种类对土壤重金属的影响
4.1.4粪肥施用种类对土壤呼吸作用的影响
4.2典型粪肥施用对土壤微生物多样性的影响
4.2.1 土壤样本测序结果
4.2.1粪肥施用种类对微生物??多样性的影响
4.3典型粪肥施用对土壤微生物群落组成结构的影响
4.3.1粪肥施用种类对土壤门水平微生物的影响
4.3.2属水平微生物群落LefSe差异统计分析
4.3.3 粪肥施用种类对微生物组成结构的影响
4.4土壤中环境因子与微生物关联性分析
4.4.1环境因子与多样性指数的Pearson相关性分析
4.4.2环境因子与群落结构的RDA冗余分析
4.4.3环境因子与优势菌门的Pearson相关性分析
4.5本章小结
第五章 有机肥施用浓度对农田土壤微生物的影响
5.1有机肥施用浓度对土壤环境因子的影响
5.1.1有机肥施用浓度对土壤pH值的影响
5.1.2有机肥施用浓度对土壤养分的影响影响
5.1.3有机肥施用浓度对土壤重金属的影响
5.1.4有机肥施用浓度对土壤呼吸速率的影响
5.2有机肥施用浓度对土壤微生物多样性的影响
5.2.1有机肥施用浓度对土壤OTU数量的影响
5.2.2有机肥施用浓度对微生物α多样性的影响
5.3有机肥施用浓度对土壤微生物群落结构的影响
5.3.1有机肥施用浓度对土壤门水平微生物的影响
5.3.2有机肥施用浓度对土壤属水平微生物的影响
5.3.3有机肥施用浓度对土壤微生物群落结构的影响
5.4土壤中环境因子与微生物关联性分析
5.4.1环境因子与多样性指数的Pearson相关性分析
5.4.2环境因子与群落结构的RDA冗余分析
5.4.3环境因子与微生物优势菌门相关性Heatmap图
5.5本章小结
第六章 结论与展望
6.1结论
6.2展望
参考文献
致谢
东华大学;
