2010～2011北京冬春季成人急性腹泻相关病毒及新发病原体分子流行病学研究

摘要

背景：
　　感染性腹泻是一种发病率高、影响范围广，并可在人群中引起严重危害的一种非常普遍的传染病，中国每年因腹泻导致的病例有100多万人次，感染性腹泻已经成为一个影响广大人群公共卫生安全的重要卫生问题。面对复杂和长期的防控形势，加强对于这一重要传染病的监测意义重大。我国近年来对于腹泻的研究越来越多，但其中关于病毒性腹泻的研究主要集中于儿童方面，尤其是5岁以下儿童，而专门针对成人病毒性腹泻的研究很少。开展成人腹泻患者中相关致病病原体的监测对于了解这一疾病的流行和危害具有重要意义，同时也可以为预防和应对随时可能暴发的腹泻疾病提供科学依据和参考资料。
　　目的：
　　掌握2010-2011北京地区成人腹泻患者中病毒性病原体病原谱和流行特征；对同时期检测到的诺如病毒、腺病毒以及一种新发病原体bufa病毒进行序列以及流行特征分析，以探讨和了解其分布特点、流行趋势、基因变异以及进化特征。
　　材料与方法：
　　采集2010-2011年就诊于北京中国人民解放军总医院（301医院）急性成人腹泻患者急性期腹泻粪便标本，共计716份，通过提取标本DNA/RNA核酸，采取PCR检测的方法对包括 A、B、C组轮状病毒（Rotavirus）、I型和II型诺如病毒（Norovirus）、星状病毒（Astrovirus）、札如病毒（Sapovirus）、腺病毒（Adenovirus）、博卡病毒（Bocavirus）、环状DNA病毒(Circovirus)、I型和II型小双节RNA病毒（Picobirnavirus）和bufa病毒（Bufavirus）共9种病毒13种病原体进行检测，对普通PCR阳性标本进行测序。
　　结果：
　　（1）本次研究共纳入符合标准成人腹泻标本716份，其中至少1种病毒检出阳性335份，阳性标本检出率为46.79％；任一病毒检出阴性标本381份，阴性标本检出率为53.21%。单一病毒阳性标本277份，单一感染率38.69%，占病毒阳性标本中的构成比为82.69%；复合感染病毒阳性标本58份，复合感染率8.1%，复合感染在所有阳性标本中的构成比为17.31%；其中复合感染中2重感染53例（91.38%），3重感染5例（8.62%），无4种及4种以上复合感染病例；病毒检出率方面，18-30岁年龄组检出率最高和60岁以上年龄组病毒检出率较低，1-4月份检出率均呈现一个较高的水平，其中4月和2月分别为检出率最高和最低的月份。
　　（2）在检测的9种病毒共13种病原体中，共检测到8种病毒共9种病原体，其中B组轮状病毒、C组轮状病毒、星状病毒和诺如病毒I型检出阳性数为0。在检出的9种病原体中，A组轮状病毒检出率最高（192/716，26.82%），其他各病毒检出率依次为诺如II型（100/716，13.97%）、博卡病毒（32/716，4.47%）、腺病毒（31/716，4.33%）、bufa病毒（18/716，2.51%）、札如病毒（8/716，1.12%）、环状DNA病毒（4/716，0.56%）、PBV1型（12/716，1.68%）、和PBV2型（1/716，0.14%）。（3）在检出的100份诺如病毒阳性标本中，成功测得RdRp基因片段以及capsid（VP1）片段并分型96份，其中诺如GII.42006b和GII.4 New Orleans2009型最多，分别为65例（65%）和22例（22%），另有GII.12/GII.3（4，4%）、GII.16/GII.2（3，3%）、GII.21/GII.13（1，1%）以及GII.6（1，1%）四种分型。
　　（4）本次研究对31例HAdv阳性标本进行测序，并成功分型。共测得3种腺病毒亚型（腺病毒B组、C组以及F组），其中F组（HAdv-40和HAdv-41型）最多，共25例，其次为B组3例（HAdv-3型和HAdv-7型）和C组3例（HAdv-1型和HAdv-6型），各分型检出数分别为HAdv-41型23例，HAdv-3、HAdv-6、HAdv-40型各2例，HAdv-1、HAdv-7型各1例。
　　结论：
　　（1）在本次研究的成人腹泻患者病毒检出率方面，A组轮状病毒和诺如病毒II型检出率最高，其次为博卡病毒、肠道腺病毒、bufa病毒、小双节RNA病毒、札如病毒和环状DNA病毒，A组轮状病毒和诺如病毒II型是本次研究中成人腹泻患者最主要检出病原体。
　　（2）GII.42006b和GII.4 New Orleans2009为2010-2011年北京地区成人腹泻患者中诺如病毒主要流行株。北京地区这一时期存在多种诺如重组株，包括GII.12/GII.3、GII.16/GII.2和GII.21/GII.13型重组株，其中GII.21/GII.13为首次在中国检出。
　　（3）本次研究中检测到的腺病毒大都为肠道 F组（HAdv-40和HAdv-41）腺病毒（80.65%，25/31），主要为HAdv-41型，其他检出腺病毒依次为HAdv-3、HAdv-6、HAdv-1、HAdv-7型。
　　（4）首次在中国地区检测到bufa病毒这一新发病原体，其中bufa病毒暂时仅在中国北方地区腹泻患者中存在并检出，但呈现一个较低的检出率，各个年龄段腹泻患者均可感染bufa病毒。

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缩略词与符号说明

前言

第一部分 成人腹泻病毒病原谱及其流行特征

1.引言

2.材料与方法

2.1 材料

2.2 方法

2.3 统计分析

三．结果

3.1 研究概况

3.2 检测结果

4． 讨论

5. 结论

第二部分 部分腹泻病毒分子流行病学研究

一、诺如病毒

1.引言

2.材料与方法

3.结果

4.讨论

5.结论

二、人腺病毒

1.引言

2.材料与方法

3.结果

4.讨论

5.结论

三、Bufa病毒

1.引言

2.材料与方法

3.结果

4.讨论

5.结论

创新点与不足之处

创新点

不足之处

参考文献

附录

致谢

综述：诺如病毒国内近年研究进展