生长素在调控茭白肉质茎起始膨大中的作用研究

目录

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摘要

缩略词表

第1章文献综述

1．1茭白和菰黑粉菌研究进展

1．1．1茭白简介

1．1．2茭白的分子生物学研究进展

1．1．3菰黑粉菌的概述

1．1．4菰黑粉菌分子生物学研究进展

1．2茭白肉质茎形成机理研究进展

1．3植物激素在茭白膨大过程中的作用

1．4二代和三代测序技术

1．4．2二代Illumina平台测序技术

1．4．3三代PacBio平台测序技术

1．5研究目的与意义

第2章菰黑粉菌全基因组测序及比较基因组学分析

2．1材料与方法

2．1．1材料

2．1．2方法

2．2结果与分析

2．2．1样品检测结果

2．2．2基因组序列混合组装结果

2．2．3基因预测与功能注释

2．2．4共有基因和特有基因分析

2．2．5基因家族分析

2．2．6系统进化分析

2．3讨论

第3章生长素在调控茭白肉质茎起始膨大中的转录组分析

3．1材料和方法

3．1．1试验材料

3．1．2试验方法

3．2结果与分析

3．2．1转录组分析概括

3．2．2以菰黑粉茵基因组为参考混合转录组测序结果分析

3．2．3以茭白基因组为参考混合转录组测序结果分析

3．2．4激素差异表达分析

3．2．5苗期与孕茭关键期茭白中内源激素的含量

3．2．6生长素差异基因荧光定量验证

3．2．7 YUCCA基因家族成员系统进化树分析

3．2．8基因结构与保守基序分析

3．2．9 YUCCA基因家族荧光定量验证

3．3讨论

第4章茭白YUCCA9基因化学诱导RNAi载体的构建

4．1材料和方法

4．1．1材料

4．1．2方法

4．2结果与分析

4．2．1 RNA完整性

4．2．2 YUCCA9正向片段和反向扩增结果

4．2．3 YUCCA9正向片段和反向片段连接结果

4．2．4 YUCCA9 RNAi片段测序检测

4．3讨论

全文总结

参考文献

致谢