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摘要
缩略词
第一章 文献综述
1作物育种及育种目标
2作物DNA分子标记、QTL定位与标记辅助育种
2．1 DNA分子标记的类型
2．2作物数量性状位点(QTL)定位
2．3标记辅助育种
3大豆常规育种和分子育种研究进展
3．1大豆种质资源的遗传变异
3．2大豆常规育种
3．3大豆分子育种研究进展
3．4大豆分子育种的应用
4本研究目的与意义
第二章材料与方法
1供试材料与田间试验
1．1供试材料
1．2田间试验设计
2表型数据测定
2．1开花期
2．2百粒重
2．3油脂与蛋白质含量
3表型数据统计分析
4基因型分型与遗传图谱构建
4．1 SNP基因型分型
4．2 SNPLDB标记分型
4．3遗传连锁图谱构建
5大豆数量性状QTL定位研究
5．1单个重组自交系群体QTL定位
5．3 QTL命名规则
6 QTL等位变异矩阵构建
7候选基因预测
第三章巢式关联作图群体QTL定位方法的比较
1开花期性状的表型变异
1．1亲本及重组自交系群体的开花期表型变异
1．2 LZTWM群体的开花期表型变异
2基因型分型
2．1重组自交系群体中SNP基因型分型
2．2 LZTWM群体中SNP基因分型
2．3 LZTWM群体中SNPLDB基因分型
3遗传图谱构建
3．1重组自交系群体遗传图谱构建
3．2 LZTWM群体遗传图谱构建
4 LZTWM群体的群体结构
5单个重组自交系群体QTL定位
5．1复合区间作图法定位
5．2基于混合模型的复合区间作图法定位
5．3复合区间作图法与基于混合模型的复合区间作图法的QTL结果比较
6巢式关联作图群体QTL定位
6．1联合完备区间作图法连锁定位
6．2混合线性模型方法关联定位
6．3限制性二阶段全基因组关联分析方法关联定位
7鉴定适合于巢式关联作图群体的高检测功效定位方法
7．1五种QTL定位方法结果比较
7．2鉴定高检测功效的定位方法
8讨论
8．1巢式关联作图群体SNP与SNPLDB标记的特点
8．2重组自交系群体的遗传图谱
8．3巢式关联作图群体的遗传结构特点
8．4巢式关联作图群体中RTM-GWAS定位方法的优势
第四章巢式关联作图群体开花期性状的遗传解析
1全基因组关联分析
1．1 LZTWM群体中开花期性状的遗传解析
1．2 LZTWM群体中开花期全基因组关联分析结果
1．3 LZTWM群体中开花期QTL-等位变异矩阵
1．4 LZTWM群体五个亲本的开花期育种潜力
1．5 LZTWM群体中开花期相关候选基因体系
2讨论
2．1开花期表现数量遗传特点
2．2本研究检测到DTF QTL与文献报道QTL比较
2．3本研究五个亲本的DTF候选基因体系与文献报道比较
第五章巢式关联作图群体百粒重性状的遗传解析
1百粒重性状的表型变异
1．1亲本及重组自交系群体的百粒重表型变异
2．2 LZTWM群体的百粒重表型变异
2全基因组关联分析
2．1 LZTWM群体中百粒重性状的遗传解析
2．2 LZTWM群体中百粒重全基因组关联分析结果
2．3 LZTWM群体百粒重QTL-等位变异矩阵
2．4 LZTWM群体五个亲本的百粒重育种潜力
2．5 LZTWM群体中百粒重相关候选基因体系
3讨论
3．1本研究检测到百粒重QTL与文献报道QTL比较
3．2 LZTWM群体中百粒重QTL-allele矩阵的遗传构成特征
第六章巢式关联作图群体油脂含量性状的遗传解析
1油脂含量性状的表型变异
1．1亲本及重组自交系群体的油脂含量表型变异
1．2 LZTWM群体的油脂含量表型变异
2全基因组关联分析
2．1 LZTWM群体中油脂含量性状的遗传解析
2．2 LZTWM群体中油脂含量全基因组关联分析结果
2．3 LZTWM群体油脂含量QTL-等位变异矩阵
2．4 LZTWM群体五个亲本的油脂含量育种潜力
2．5 LZTWM群体中油脂含量相关候选基因体系
3讨论
3．2 LZTWM群体中油脂含量QTL-allele矩阵的遗传构成特征
第七章巢式关联作图群体蛋白质含量性状的遗传解析
1蛋白质含量性状的表型变异
1．1亲本及重组自交系群体的蛋白质含量表型变异
1．2巢式关联作图群体的蛋白质含量表型变异
2全基因组关联分析
2．1 LZTWM群体中蛋白质含量性状的遗传解析
2．2 LZTWM群体中蛋白质含量全基因组关联分析结果
2．3 LZTWM群体蛋白质含量QTL-等位变异矩阵
2．4 LZTWM群体五个亲本的蛋白质含量育种潜力
2．5 LZTWM群体中蛋白质含量相关候选基因体系
2．6 LZTWM群体中调控籽粒性状的一因多效QTL
3讨论
3．1本研究检测到蛋白质含量QTL与文献报道QTL比较
3．2 LZTWM群体中蛋白质含量QTL-allele矩阵的遗传构成特征
第八章全文结论和创新点
1全文主要结论
2全文主要创新点
参考文献
攻读博士学位期间发表的学术论文
致谢
南京农业大学;
