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油菜巢式关联作图群体的遗传特性及开花期QTL解析

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摘要

缩略词表

1文献综述

1.1数量性状遗传定位

1.1.1连锁分析与关联分析的比较

1.1.2连锁分析与关联分析的整合应用

1.1.3二代测序技术在数量性状遗传定位中的应用

1.1.4基于SNP标记的高密度遗传图谱构建

1.2拟南芥及油菜开花期相关研究进展

1.2.1拟南芥主要开花调控途径

1.2.2油菜开花调控研究进展

1.3本研究的目的及意义

2油菜巢式关联作图群体的遗传特性解析

2.1前言

2.2材料与方法

2.2.1供试材料及BN-NAM群体构建

2.2.2 DNA的提取及基因分型

2.2.3 SNP标记筛选及异常家系的鉴定

2.2.4三种遗传图谱的构建

2.2.5群体结构及亲缘关系分析

2.2.6连锁不平衡分析

2.2.7偏分离的检测

2.3结果与分析

2.3.1 BN-NAM群体的构建及遗传图谱的特性

2.3.2 BN-NAM的群体结构及亲缘关系分析

2.3.3 BN-NAM群体的LD分析

2.3.4重组事件及重组率的评估

2.3.5各个RIL群体上标记的偏分离

2.3.6剩余杂合系

2.4讨论

2.4.1 BN-NAM群体具有丰富的遗传变异信息

2.4.2 BN-NAM群体的群体结构

2.4.3 BN-NAM群体的LD及重组

3 BN-NAM群体开花期性状的QTL解析

3.2.2田间实验及性状调查

3.2.3表型的统计分析

3.2.4三种遗传图谱的重新构建

3.2.5连锁QTL作图方法

3.2.6联合连锁QTL作图方法

3.2.7全基因组关联分析作图方法

3.2.8候选基因的鉴定

3.3结果与分析

3.3.1更新的遗传图谱信息

3.3.2开花期表型统计分析

3.3.3各个RIL群体的连锁分析

3.3.4 BN-NAM群体的联合连锁分析

3.3.5全基因组关联分析

3.3.6三种方法QTL整合及比较

3.3.7候选基因预测及重要开花位点的鉴定

3.4讨论

3.4.1三种QTL定位方法的特点及比较

3.4.2开花期候选基因

3.5小结与展望

参考文献

附录

致谢

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