五个蔷薇科物种SPL基因家族的全基因组鉴定及其在森林草莓中的表达分析

目录

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摘要

第一章文献综述

1．1转录因子的功能结构域

1．2转录因子的调节

1．3转录因子的生物学功能

2植物SPL转录因子的研究现状

2．1 SPL基因的结构

2．2 SPL转录因子的表达调控

2．3 SPL基因的生物学功能

3本文的主要内容及意义

第二章五个蔷薇科物种SPL基因的鉴定和进化分析

1材料和方法

1．1五个蔷薇科物种的SPL基因鉴定

1．2多序列比对及系统发生树的构建

1．3非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks)计算

2结果与分析

2．1五个蔷薇科物种SPL基因的鉴定

2．2五个蔷薇科物种SPL基因的系统发生树及其复制事件

2．3五个蔷薇科物种的SPL基因复制时间

2．4五个蔷薇科物种的SPL基因的选择压力

3讨论

参考文献

第三章草莓SPL基因生物信息学分析

1材料和方法

1．1草莓SPL基因蛋白结构域鉴定及分析

1．2草莓SPL基因染色体定位及基因复制

1．3草莓SPL基因序列比对及系统发生树构建

1．4草莓SPL基因的基因结构与保守基序分析

1．5草莓SPL基因miR156靶位点预测

2结果与分析

2．1草莓SPL基因蛋白结构域鉴定及分析

2．2草莓SPL基因染色体定位及基因复制

2．3草莓SPL基因的系统发生树、基因结构与保守基序分析

2．4草莓miR156靶基因和靶位点预测

3讨论

参考文献

第四章草莓SPL基因在不同器官中的表达分析

1材料和方法

1．1植物材料

1．2主要试剂及仪器

1．3引物

1．4方法

2结果与分析

2．1草莓不同组织器官的RNA提取

2．2荧光引物筛选

2．3草莓SPL基因家族的表达分析

3讨论

参考文献

全文结论

创新点

附录

攻读学位期间发表的学术论文

致谢