使用随机突变碱基序列模拟脊索动物TF4基因内含子的演化

目录

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第一章 绪论

1.1内含子概述

1.2内含子的起源与演化学说

1.2.1 内含子早现假说

1.2.2 内含子晚现假说

1.3 序列模拟

1.4研究的目的与意义

1.5研究内容和技术路线

1.5.1研究内容

1.5.2技术路线

第二章 脊索动物内含子序列演化模拟

2.1 材料与方法

2.1.1 脊索动物内含子序列

2.1.2 构建进化树与计算特征值

2.1.3 祖先内含子序列

2.1.4 MD模型

2.1.5 MI模型

2.2模型测试与参数设定

2.2.1 MD模型测试

2.2.2 MD模型运行参数的设置

2.2.3 MI模型测试

2.2.4 MI模型运行参数的设置

2.2.5 统计分析

2.3结果与讨论

2.3.1 MD模型测试结果分析

2.3.2 MI模型测试结果分析

2.4本章小结

第三章 脊索动物内含子演化模型的优化

3.1 材料与方法

3.1.1 脊索动物内含子序列

3.1.2 随机突变内含子序列一个碱基

3.1.3 MD17~MD24测试的参数设定

3.1.4 MI17~MI24测试的参数设定

3.1.5 统计分析

3.2 结果与讨论

3.2.1 突变后的特征值计算

3.2.2 MD17~MD24测试结果分析

3.2.3 MI17~MI24测试结果分析

3.3 本章小结

第四章 结论与展望

4.1 结论

4.2 展望

参考文献

致谢

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