山羊LPL基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析

摘要

脂蛋白脂酶（Lipoprotein lipase，LPL）基因是一种在脂肪代谢过程中起关键作用的蛋白水解酶。LPL基因已被看做是影响 IMF的候选基因。提高山羊脂肪沉积能力，有利于获得与山羊肌肉脂肪性状相关的标记位点。本研究选用安徽白山羊、波尔山羊、马头山羊、济宁青山羊、岷山黑裘皮羊、临朐奶山羊等6种山羊群体为试验动物，采用PCR-SSCP分析方法研究 LPL基因的多态型，并运用GLM模型，对检测出来的的SNP及其与羊IMF的关联分析。
　　1.根据 GenBank上公开发表的相关山羊 LPL基因，设计引物 P1-P10，应用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上发现P1-SSCP多态位点，该位点上具有五种基因型AA、BB、AB、AC和 BC。序列测定结果表明，P1-SSCP的变异是由碱基 G→287A的替换造成的。在P6-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、BB、AB。序列测定结果表明，P6-SSCP变异是由碱基 G→16997A的替换造成，Gln→Ser。在 P7-SSCP多态位点上发现三种基因型 AA、BB、AB。序列测定结果表明，P7-SSCP变异是由碱基 A→18313C替换造成，导致Asp→Ala。
　　2.在上述6个群体中分析了 PCR-SSCP位点的基因型分布情况，Hardy-Weinberg检验结果表明：在 P1-SSCP位点上，除安徽白山羊之外，所有品种均达到 Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。在 P6-SSCP位点和在 P7-SSCP位点上，所有品种均达到Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。
　　3.根据 SNP群体动力学分析，287G、18313A在6个群体中分布均较稳定，16997G在群体中表现一定特异性，安徽白山羊分布达0.9750，波尔山羊0.8828，马头山羊0.8333，临朐奶山羊0.7500，济宁青山羊0.7037，岷山黑裘皮山羊中分布率最低是0.6979。G-16997A与IMF呈负相关性；A-18313C位点与IMF显著相关联（P<0.05），这说明P7位点处A-18313C与脂肪沉积能力有相关性。

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缩略词表

前言

1脂蛋白脂酶基因（LPL）的研究进展

2 SNP研究与PCR-SSCP方法

3 研究目的与意义

第二章材料与方法

1 试验群体

2 试验器材及试剂、软件

3 主要试剂的配置方法

4 试验方法

5 试验引物设计与筛选

6 PCR扩增与产物检测

7 统计分析方法

三．结果与分析

1 山羊血液中DNA基因组提取结果

2 山羊LPL第1外显子克隆及序列分析

3 山羊LPL第6外显子克隆及序列分

4 山羊LPL第7外显子克隆及序列分析

5 群体动力学分析

第四章讨论

1 血液样品的采集

2 影响PCR扩增的因素

3 PCR-SSCP技术的主要影响因素

4 山羊LPL基因多态性及其与脂肪沉积关联分析

第五章结论

参考文献

致谢

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