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第一章 引言
1.1鱼类肠道菌群的形成
1.2鱼类肠道菌群的组成及数量
1.3鱼类肠道菌群的生理功能
1.3.1 营养功能
1.3.2防御功能
1.4消化道菌群结构研究手段
1.4.1核糖体16S RNA技术
1.4.2遗传指纹技术(DNA Fingerprint Techniques)
1.4.3核酸分子杂交技术
1.4.4实时荧光定量PCR技术(Real-time PCR)
1.4.5微生物群落功能多样性的研究
1.5问题与展望
第二章 不同养殖环境对鲫鱼肠道菌群的影响
2.1材料与方法
2.1.1材料
2.1.2菌种和质粒
2.1.3工具酶
2.1.4仪器和试剂
2.1.5溶液
2.1.6培养基
2.1.7鲫鱼肠道的处理
2.1.8水体样品菌体收集
2.1.9总DNA的提取
2.1.10 PCR扩增
2.1.11变性梯度凝胶电泳(DGE)
2.1.12 DNA片段的回收和连接
2.1.13感受态细胞的制备
2.1.14电转化
2.1.15 DNA测序
2.1.16 DGGE图谱中部分优势条带的序列分析和系统发育分析
2.2结果与分析
2.2.1总DNA的提取及PCR扩增
2.2.2 DGGE指纹图谱建立及分析
2.2.3部分优势条带的序列比对与系统发育树分析
2.3讨论
2.4本章小结
第三章草鱼肠道菌群营养分子生态的研究
3.1材料与方法
3.1.1样品采集及饲料成分
3.1.2菌种和质粒,工具酶,仪器和试剂,溶液,培养基
3.1.3草鱼肠道的处理
3.1.4总DNA的提取
3.1.5 PCR扩增
3.1.6变性梯度凝胶电泳(DGGE)
3.1.7 DNA片段的回收和连接,感受态细胞的制备,电转化,重组子筛选
3.1.8 DNA测序
3.1.9 DGGE图谱中部分优势条带的序列分析和系统发育分析
3.2结果与分析
3.2.1肠衣粉替代豆粕对草鱼肠道菌群的影响
3.2.2高能饮料对草鱼肠道菌群的影响
3.2.3棉粕替代菜粕对草鱼肠道菌群的影响
3.2.4饲料中玉米添加水平对草鱼肠道菌群的影响
3.2.5 DDGS替代麦芽根对草鱼肠道菌群的影响
3.3本章小结
第四章结论
参考文献
致谢
华中农业大学;