银川高砷含水层沉积物和深层地下水中微生物群落结构和功能的宏基因组学研究

目录

第1章绪 论

1.1.1 研究背景

1.1.2 研究意义

1.2.1 环境中的砷元素

1.2.2 砷去除方法

1.2.3 砷污染环境中的微生物群落

1.2.4 微生物的砷抗性机制

1.3.1 研究目标

1.3.2 研究内容

1.3.3 技术路线

1.3.4 创新点

第2章研究区域概况和研究方法

2.1 研究区域

2.1.1 银川平原自然地理概况

2.1.2 银川平原地下水砷污染现状

2.2 样品采集与理化性质检测

2.2.1 样品采集

2.2.2 样品测试

2.3 研究方法

2.3.1 样品总DNA提取

2.3.2 聚合酶链式反应

2.3.3 高通量测序

2.3.4 数据分析流程

第3章高砷含水层沉积物微生物群落结构及功能分析

3.1 含水层沉积物的物化特征

3.2 微生物群落结构和分布特征

3.3 微生物群落Alpha多样性

3.4 微生物群落Beta多样性

3.5 宏基因组数据质量

3.6 宏基因组分箱分析

3.7 系统发育及菌群携带的砷抗性基因分析

3.8 本章小结

第4章深层地下水和沉积物微生物群落及功能分析

4.1 地下水和沉积物中微生物群落组成及多样性

4.2 微生物群落结构和分布特征

4.3 宏基因组数据质量及组装结果

4.4 宏基因组分箱分析

4.5 系统进化分析

4.6 群落功能分析

4.7 本章小结

结 论

参考文献

声明

致 谢