基于深度学习的转录因子靶基因预测研究

目录

第1章绪 论

1.1 课题研究背景及意义

1.2 国内外相关研究现状

1.3 本文研究内容

1.4 本文组织结构

第2章转录因子靶基因预测相关研究概述

2.1 引言

2.2 转录因子结合位点预测相关研究

2.3 转录因子靶基因预测相关研究

2.3.1 基于距离规则的转录因子靶基因预测方法

2.3.2 基于统计相关性的转录因子靶基因预测方法

2.3.3 基于机器学习的转录因子靶基因预测方法

2.4 本章小结

第3章基于LSTM和注意力机制的转录因子靶基因预测

3.1 引言

3.2 转录因子靶基因数据集构建及分析

3.2.1 转录因子结合位点数据

3.2.2 基因表示构建

3.3 基因序列特征提取

3.3.1 基于 LSTM 的基因特征提取

3.3.2 基于 CNN 的基因特征提取

3.4 基于 LSTM 和注意力机制的转录因子靶基因预测

3.4.1 注意力机制

3.4.2 结合注意力机制的转录因子靶基因预测方法

3.5 实验结果及分析

3.5.1 实验设置

3.5.2 实验结果分析

3.6 本章小结

第4章结合迁移学习和对抗训练的转录因子靶基因预测

4.1 引言

4.2 迁移学习和对抗学习

4.2.1 迁移学习

4.2.2 对抗学习

4.3 结合迁移学习和对抗训练的转录因子靶基因预测

4.3.1 基于迁移学习的转录因子靶基因预测方法

4.3.2 结合对抗训练的转录因子靶基因预测方法

4.4 实验结果及分析

4.4.1 实验设置

4.4.2 实验结果分析

4.5 本章小结

结 论

参考文献

附录

声明

致 谢