长链非编码RNA PCAT1遗传变异SNPs与乳腺癌遗传易感性关联分析及初步功能验证

目录

声明

英文缩略词表

1 前言

2 材料方法

2.1 技术路线

2.2 生物信息学方法筛选lncRNA PCAT1标签及功能性SNPs

2.2.1 PCAT1标签及功能性SNPs的选择

2.2.2 预测PCAT1候选SNPs的功能

2.3 生物学实验

2.3.1 实验仪器

2.3.2 实验试剂

2.3.3 溶液的配制

2.4 研究方法

2.4.1 研究对象

2.4.2 资料收集

2.4.3 血样的采集

2.4.4 血液中基因组的DNA的提取

2.4.5 基因分型

2.4.6 实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）

2.4.7 双荧光素酶报告基因验证SNP对PCAT1与miRNA结合能力的影响

2.4.8 敲低或过表达的与PCAT1 SNP相结合的miRNA对细胞增殖、侵袭和转移功能的影响

2.4.9 统计学分析

2.4.10 质量控制

3 结果

3.1 本研究中纳入对象的基本信息的描述

3.2 SNPs的基因分型结果

3.2.1 PCAT1 SNPs位点的电泳峰型图

3.2.2 PCAT1 SNP位点rs4473999的凝胶电泳图及测序结果图

3.3 PCAT1 8个SNPs位点与乳腺癌之间易感性分析

3.4 PCAT1 8个SNPs位点与乳腺癌之间遗传易感性的分层分析

3.5 SNPs与乳腺癌的激素受体状态（ER、PR、HER-2）之间的关联性分析

3.6 SNPs与乳腺癌不同分子分型之间的关联分析

3.7 PCAT1 8个SNPs的单倍型分析

3.8 基因与生殖因素之间的交互作用分析

3.9 假阳性报告率分析

3.10 PCAT1的qRT-PCR结果

3.11 双荧光素酶报告基因的实验结果

3.11.1 PCAT1 rs4473999双荧光素酶载体构建的测序结果

3.11.2 PCAT1 rs4473999 C/T变异对PCAT1与miR-149-5p的结合能力影响

3.12 与PCAT1 SNP相结合的miR-149-5p对乳腺癌细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响

3.12.1 与PCAT1SNP相结合的miR-149-5p在乳腺癌细胞系中的相对表达量

3.12.2 与PCAT1SNP相结合的miR-149-5p慢病毒敲低和过表达效果的验证

3.12.3 CCK8实验结果

3.12.4 划痕实验结果

3.12.5 Transwell实验结果

4 讨论

4.1 LncRNA PCAT1遗传变异SNPs与乳腺癌遗传易感性之间的关联

4.2 基因生殖因素交互作用与乳腺癌

4.3 LncRNA PCAT1遗传变异SNP初步的功能研究

4.3.1 rs1551514与乳腺癌

4.3.2 rs4473999与乳腺癌

4.4 本研究的优点与局限性

5 结论

参考文献

综述:LncRNA PCAT1:人类癌症中一种关键的长链非编码RNA

1 PCAT1简介

2 人类癌症中的PCAT1

2.1 前列腺癌

2.2 肝癌

2.3 结直肠癌

2.4 胃癌

2.5 其他癌症

3 PCAT1作用的可能分子机制

3.1 PCAT1通过调节BRCA2参与双链DNA断裂修复

3.2 PCAT1与PRC2复合核之间的相互作用

3.3 PCAT1与c-Myc的相互作用

3.4 PCAT1和单核苷酸多态性

3.5 PCAT1充当microRNA海绵

3.6 其他监管机制

4 PCAT1在癌症中的临床应用

4.1 PCAT1作为治疗的靶点

4.2 PCAT1作为诊断和预后标志物

5 结论和未来前景

个人简历及学术论文发表情况

1基本信息

2学习经历

3学术论文发表情况

致谢