楔缘金小蜂属分子系统发育研究初探（膜翅目：小蜂总科：金小蜂科）

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第一章 楔缘金小蜂研究综述

1.1 楔缘金小蜂属概况

1.1.1 楔缘金小蜂属的分类地位

1.1.2 楔缘金小蜂属研究进展

1.1.3 楔缘金小蜂属鉴别特征

1.2 楔缘金小蜂分子系统学研究

1.2.1 分子系统学简介

1.2.2 楔缘金小蜂属分子系统学研究进展

1.2.3 分子标记基因选择

1.2.4 系统发育树构建方法

1.3 楔缘金小蜂属研究的目的和意义

第二章 材料和方法

2.1 研究材料

2.1.1 楔缘金小蜂属标本及其采集方法

2.1.2 主要仪器

2.1.3 主要试剂及耗材

2.2 DNA处理方法

2.2.1 DNA提取方法

2.2.2 PCR扩增

2.3 数据处理、分析

2.3.1 序列拼接和比对

2.3.2 序列组成分析

2.3.3 替换饱和度检验

2.3.4 jMOTU以及ABGD阈值分析

2.3.5 核苷酸替代模型选择

2.3.6 系统发育树的构建

第三章 楔缘金小蜂基因片段分析及系统发育研究

3.1 基于COI基因的分子数据特征及其系统发育分析

3.1.1 基本序列特征分析

3.1.2 饱和性检测

3.1.3 jMOTU和ABGD分析

3.1.4 系统发育关系分析

3.2 基于 28S rDNA 基因的分子数据特征及其系统发育分析

3.2.1 基本序列特征分析

3.2.2 饱和性检测

3.2.3 jMOTU和ABGD分析

3.2.4 系统发育关系分析

3.3 基于18S rDNA基因的分子数据特征及其系统发育分析

3.3.1 基本序列特征分析

3.3.2 饱和性检测

3.3.3 jMOTU和ABGD分析

3.3.4 系统发育关系分析

3.4 基于ITS2基因的分子数据特征及其系统发育分析

3.4.1 基本系列特征分析

3.4.2 饱和性检测

3.4.3 jMOTU和ABGD分析

3.4.4 系统发育关系分析

3.5 基于联合基因的系统发育分析

3.5.1 基于COI与ITS2基因的系统发育分析

3.5.2 基于COI与28S rDNA基因的系统发育分析

第四章 结论与讨论

4.1 总结与讨论

4.2 创新点

4.3 研究不足

4.4 展望

参考文献

致谢