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前 言
第一章 文献综述
1.1茶树叶部病害以及防治研究进展
1.2茶轮斑病的研究进展
1.3宁南霉素相关的研究进展
1.4转录组学的主要研究进展
1.4.1 转录组学在植物胁迫响应方面的研究进展
1.4.2 转录组学在病原微生物与寄主互作方面的研究进展
1.4.3转录组学在药剂作用机理方面的研究进展
1.4.4转录组学在其它方面研究进展
1.5小结
第二章 设计思路及研究路线
2.1论文选题的目的和意义
2.2拟解决的关键问题
2.3研究内容
2.4技术路线
第三章 实验材料与方法
3.1实验材料
3.1.1供试的菌株
3.1.2 试验仪器
3.1.3 试验试剂
3.2 宁南霉素对菌株GZHS-2017-010的抑菌活性
3.3宁南霉素对菌株GZHS-2017-010的形态学影响
3.3.1样品的制备
3.3.2扫描电镜观察
3.3.3透射电镜观察
3.4转录组测序研究宁南霉素对菌株GZHS-2017-010的基因表达的影响
3.4.1 菌株GZHS-2017-010的样品制备
3.4.2 mRNA文库构建和测序
3.4.3针对测序序列的统计与质控
3.4.4采用生物信息学进行数据分析
3.5 利用RT-qPCR验证差异表达的基因
3.5.1 RNA的样品制备
3.5.2 RT-qPCR的引物设计
3.5.3 RNA的反转录
3.5.4 RT-qPCR反应程序
第四章 结果与讨论
4.1不同药剂对菌株GZHS-2017-010的离体抑菌活性
4.2形态学观察宁南霉素对菌株GZHS-2017-010的影响
4.2.1扫描电镜观察
4.2.2 透射电镜观察
4.3转录组学分析宁南霉素对菌株GZHS-2017-010的基因表达
4.3.1转录组样品的质量控制
4.3.2差异基因的筛选
4.3.3采用生物信息学分析差异基因
4.3.4转录组数据中的差异基因的验证
4.3.5主要通路中的差异基因分析
第五章 结论
5.1主要研究结果
5.1.1药剂抑菌活性测定
5.1.2扫描电镜及透射电镜结果分析
5.1.3研究宁南霉素对菌株GZHS-2017-010的作用机理
5.2创新之处
5.3不足之处及展望
致 谢
参考文献
附 录
(一) 课题来源
(二) 论文发表情况
(三) 附表
声明
贵州大学;
