干旱胁迫下花生转录组与小RNA测序及相关基因的表达分析

目录

第1章 前言

1.1 干旱对植物的影响

1.1.1 干旱对植物的形态构建的影响

1.1.2干旱对植物的光合和代谢的影响

1.2 植物对干旱胁迫的适应

1.2.1干旱胁迫应答相关基因的表达调控

1.2.2渗透调节

1.2.3抗氧化防御机制

1.2.4脱落酸调节机制

1.2.5干旱胁迫保护性蛋白的调控

1.3 miRNA与植物干旱胁迫

1.4 高通量测序技术

1.4.1转录组测序在花生干旱研究上的运用

1.4.2 miRNA测序在花生抗旱研究上的运用

1.5研究的目的及意义

第2章 干旱胁迫下花生转录组测序及相关基因的表达分析

2.1 材料和方法

2.1.1 实验材料及准备

2.1.2 主要试剂

2.1.3 主要仪器和设备

2.2 实验方法

2.2.1 花生干旱生理生化指标的测定

2.2.2 花生总RNA的提取、文库构建及测序

2.2.3 数据处理和分析

2.2.4 RT-PCR验证

2.3 结果与分析

2.3.1 PEG模拟干旱对花生幼苗生理指标的影响

2.3.2 RNA的质量检测

2.3.3 测序数据统计分析

2.3.4 转录因子家族分类与统计分析

2.3.5 基因定量分析

2.3.6 差异表达基因统计分析

2.3.7 差异基因的功能分类和富集分析

2.3.8 与花生干旱相关的基因

2.3.9 RT-PCR验证

2.4 讨论

2.4.1 干旱胁迫下花生根系转录组测序

2.4.2 干旱处理对花生幼苗生理活性的影晌

2.4.3 花生根系抗旱功能相关基因

第3章 小RNA测序及相关miRNA的差异表达分析

3.1 材料

3.1.1 花生材料准备

3.1.2 主要试剂

3.1.3 主要仪器和设备

3.2 实验方法

3.2.1 花生总RNA的提取、文库构建及测序

3.2.2 数据处理和分析

3.2.3 RT-PCR验证

3.3结果与分析

3.3.1 测序数据统计分析

3.3.2 miRNAs 的鉴定

3.3.3 差异表达 miRNA 统计分析

3.3.4 差异表达 miRNA 的靶基因预测

3.3.5 差异表达 miRNA 的靶基因注释

3.3.6 与花生干旱相关的miRNA及靶基因预测

3.3.7 RT-PCR验证

3.4讨论

3.4.1 干旱胁迫下花生根系小RNA测序

3.4.2 花生根系抗旱功能相关miRNA

第4章 ahyNAC25基因的克隆及遗传转化

4.1 实验材料

4.1.1材料

4.1.2 主要试剂及酶类

4.1.3主要仪器

4.2 实验方法

4.2.1花生NAC25基因的扩增

4.2.2 植物表达载体的构建

4.2.3植物表达载体转化农杆菌

4.2.4 花生ahyNAC25的转化及转基因植株的筛选

4.2.5 转基因拟南芥的分子鉴定

4.3结果与分析

4.3.1 ahyNAC25基因的生物信息学分析

4.3.2 ahyNAC25基因的遗传转化

4.4讨论

第5章 结论与展望

5.1结论

5.2展望

参考文献

附录

攻读硕士学位期间发表论文情况

致谢

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