侵染共同寄主本氏烟时RSV和TSWV帽子序列谱的测定和比较

目录

声明

第一章 前言

1.1 水稻条纹病毒研究概述

1.2 番茄斑萎病毒研究概况

1.3 病毒抓帽机制研究

1.3.1 帽子结构的概述

1.3.2 病毒与帽子结构

1.3.3 病毒的加帽方式

1.3.4 病毒的抓帽机制

1.3.5 病毒的抓帽过程

第二章 基于帽子序列谱的TSWV和RSV“抓帽”机制比较

2.1 实验材料与试剂

2.1.1 植物病毒毒株来源

2.1.2 供试菌株、载体和主要试剂

2.1.3 PCR引物

2.2 实验方法

2.2.1 病毒的接种

2.2.2 RNA样品的提取

2.2.3 CIP处理RNA样品

2.2.4 RPPH处理样品RNA

2.2.5 加linker处理RNA样品

2.2.6 cDNA的合成

2.2.7 PCR扩增

2.2.8 胶回收过程

2.2.9 克隆载体与产物连接

2.2.10 连接产物转化大肠杆菌

2.2.11 筛选阳性克隆

2.2.12 处理高通量测序结果

2.3 结果与分析

2.3.1 RSV/TSWV mRNA 5’端高通量测序及其与寄主mRNA 5’端的比对

2.3.2 RSV/TSWV mRNA的分类

2.3.3 RSV和TSWV帽子序列长度比较

2.3.4 RSV和TSWV对帽子序列末端碱基的偏好性比较

2.3.5 RSV和TSWV对引发与重配的使用频率比较

2.3.6 帽子序列3’端碱基对RSV和TSWV使用引发与重配频率的影响

2.3.7 帽子序列长度对RSV和TSWV使用引发与重配频率的影响

2.3.8 RSV和TSWV帽子序列的来源（寄主mRNA）分析

第三章 全文总结与讨论

参考文献

攻读硕士学位期间参与发表的学术论文

致谢