基于多组学技术揭示S--木质素与纤维品质的关系

目录

声明

主要符号对照表

第一章 引言

1.1 木质素的生物合成

1.2 棉花纤维发育

1.3 木质素与纤维品质关系的研究进展

1.4 多组学技术在木质素合成相关基因鉴定中的应用

1.4.1 基因组学技术的应用

1.4.2 转录组学技术的应用

1.4.3 代谢组学技术的应用

1.5本次研究的目的、意义

第二章 材料与方法

2.1 试验材料

2.1.1 植物材料

2.1.2 仪器设备、软件及用途

2.1.3 载体菌株

2.1.4 实验所用试剂

2.1.5 引物合成及基因测序

2.2 木质素通路相关基因的鉴定

2.3 木质素通路相关基因的表达分析

2.3.1 转录组分析

2.3.2 RNA的提取

2.3.3 棉花反转录反应cDNA获得

2.3.4 qRT-PCR

2.4 CAD基因家族的系统进化分析

2.4.1 构建系统发育树

2.4.2 基因结构分析

2.4.3 Motif及等电点分析

2.4.4 启动子分析

2.5 亚细胞定位

2.5.1 目的基因扩增

2.5.2 构建重组质粒载体

2.5.3 农杆菌感受态细胞制作及转化

2.5.4 GhCAD7-GFP转农杆菌并注射烟草

2.6 木质素途径相关代谢产物的提取，检测和分析

2.6.1 样品提取流程

2.6.2 色谱质谱采集条件

2.6.3 数据处理

2.7 拟南芥中过表达GhCAD7基因

2.7.1 目的基因扩增

2.7.2 构建重组质粒载体

2.7.3 拟南芥中过表达GhCAD7基因

第三章 结果与分析

3.1 木质素生物合成相关基因的鉴定与筛选

3.2 木质素生物合成相关基因的表达分析

3.3 CAD基因家族的相关分析

3.3.1 CAD家族成员基本特征分析

3.3.2 CAD家族进化树分析

3.3.3基因结构及motif分析

3.3.4 GhCAD7的启动子分析

3.4 GhCAD7蛋白的亚细胞定位

3.5 木质素通路相关代谢物分析

3.6 拟南芥中过表达GhCAD7基因

3.6.1 GhCAD7基因的克隆

3.6.2 重组质粒载体的构建

3.6.3 拟南芥中过表达GhCAD7的T1代阳性苗筛选

第四章 讨论

4.1 棉纤维中木质素合成相关基因

4.2 木质素合成通路相关基因的表达

4.3 木质素合成通路小分子代谢物的分析

第五章 结论

参考文献

附录A

致谢

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