绵羊性腺组织piRNAs序列特征及其在单多羔绵羊间的表达差异分析

目录

声明

主要符号对照表

第一章 绪论

1.1 引言

1.2 piRNA及其在繁殖调控中的研究进展

1.2.1 piRNA的发现

1.2.2 piRNA的生成机制

1.2.3 piRNA的序列特征

1.2.4 piRNA的基因组分布特征

1.2.5 piRNA的表观遗传调控作用

1.2.6 piRNA在繁殖调控中的研究进展

1.2.7 piRNA在家畜中的研究进展

1.3 本研究的内容和目的

第二章 材料与方法

2.1绵羊睾丸组织采集

2.2绵羊卵巢组织采集

2.3总RNA提取

2.4小RNA文库构建及测序

2.5 piRNA序列筛选

2.6 piRNA序列长度和碱基分布分析

2.7 piRNA乒乓结构特征分析

2.8 piRNA比对基因组区域分析

2.9 piRNA比对转座子序列分析

2.10 piRNA的染色体分布和链特异性

2.11 单多羔绵羊性腺组织差异piRNA筛选

2.12 单多羔绵羊性腺组织差异piRNA靶基因预测

2.13 单多羔绵羊性腺组织差异piRNA靶基因GO和KEGG功能富集分析

第三章 结果与分析

3.1 绵羊性腺组织piRNA序列鉴定

3.2 绵羊性腺组织piRNA长度分布和碱基分布

3.3 绵羊性腺组织piRNA序列的乒乓结构特征

3.4 绵羊性腺组织piRNA在基因组中的分布区域

3.5 绵羊性腺组织中piRNA比对转座元件类型及各类型来源piRNA乒乓结构特征

3.6 绵羊性腺组织piRNA染色体分布及DNA链分布

3.7单多羔品种绵羊睾丸组织piRNA差异表达分析

3.7.1差异piRNA筛选及靶基因预测

3.7.2差异piRNA靶基因GO富集分析

3.7.3差异piRNA靶基因KEGG富集分析

3.8 单多羔小尾寒羊卵巢组织piRNA差异表达分析

3.8.1差异piRNA筛选及靶基因预测

3.8.2差异piRNA靶基因GO富集分析

3.8.3高低繁殖力小尾寒羊卵巢组织差异piRNA靶基因KEGG富集分析

第四章 讨论

4.1 绵羊性腺组织piRNAs序列特征

4.2 单多羔绵羊睾丸组织差异piRNAs功能预测

4.3 单多羔绵羊卵巢组织差异piRNAs功能预测

第五章 结论

参考文献

致 谢

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