转录组学解析二马牙型与长脖型林下参表型的研究

目录

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主要符号对照表

第一章 绪论

1.1林下参概况

1.1.1林下参种植现状

1.1.2环境因子对林下参的影响

1.1.3人参种质资源研究现状

1.2转录组在人参属植物中的研究进展

1.2.1转录组学在人参皂苷合成领域中的应用

1.2.2转录组学在人参属逆境响应中的应用

1.2.3转录组学在人参属连作障碍中的应用

1.2.4转录组学在人参属种子中的应用

1.2.5转录组学在人参属中其他领域中的应用

1.3转录组学在植物表型性状研究中的应用

1.4目的及意义

第二章 两种类型林下参生理指标比较

2.1试验材料

2.2试验仪器及试剂耗材

2.3试验方法

2.3.1农艺性状测定

2.3.2叶绿素荧光测定

2.3.3人参皂苷含量测定

2.3.4四种糖含量测定

2.4结果与分析

2.4.1两类型林下参农艺性状比较

2.4.2两类型林下参光系统Ⅱ比较

2.4.3两类型林下参人参皂苷含量比较

2.4.4两类型林下参四种糖含量比较

2.5讨论

2.5.1两类型林下参表型差异分析

2.5.2两类型林下参光合速率差异分析

2.5.3两类型林下参化学成分差异分析

2.6小结

第三章 两种类型林下参转录组分析

3.1试验材料

3.2试验仪器及试剂耗材

3.2.1试验仪器

3.2.2试剂耗材

3.3试验方法

3.3.1 RNA的提取

3.3.2 RNA-seq文库的构建

3.3.3文库质控

3.3.4上机测序

3.3.5测序数据质量评估

3.3.6基因表达量分析

3.3.7实时荧光定量PCR

3.4结果与分析

3.4.1 RNA样品质量分析

3.4.2测序产量统计与质量分析

3.4.3比对效率统计与分析

3.4.4表达量主成分分析

3.4.5差异表达基因统计

3.4.6差异表达基因的GO分析及KEGG富集分析

3.4.7关键通路基因转录表达分析

3.4.8 RNA-seq的验证分析

3.5讨论

3.5.1淀粉与蔗糖代谢通路中差异表达分析

3.5.2生长素作用过程差异表达分析

3.5.3木质素生物合成差异表达分析

3.5.4两种类型林下参抗逆性分析

3.6小结

第四章 结论

参考文献

致谢

作者简历