梅花鹿鹿茸产量相关SNP的开发与验证

目录

声明

主要符号对照表

第一章 绪论

1.1 梅花鹿养殖及育种现状

1.1.1 梅花鹿养殖现状

1.1.2 梅花鹿育种现状

1.2 梅花鹿产茸性能的影响因素

1.2.1 内在因素

1.2.2 外在因素

1.3 全基因组重测序技术在畜禽中的应用

1.3.1 全基因组重测序在猪中的应用

1.3.2 全基因组重测序在牛中的应用

1.3.3 全基因组重测序在羊中的应用

1.3.4 全基因组重测序在禽类中的应用

1.3.5 全基因组重测序在鹿中的应用

1.4 质谱SNP分型技术

1.4.1 SNP分型检测方法

1.4.2 MassARRAY SNP检测流程

1.5 分子标记辅助选择的应用

1.5.1 分子标记辅助选择技术

1.5.2 分子标记辅助选择在动物育种中的应用

1.6 本研究目的意义

第二章 梅花鹿产茸性能分析与估测

2.1 材料与方法

2.1.1 试验材料

2.1.2 统计方法

2.2 结果与分析

2.2.1 四平梅花鹿1~9锯三杈鲜茸重统计

2.2.2 四平梅花鹿最佳生茸年龄及年龄范围

2.2.3 四平梅花鹿产茸量与年龄的关系

2.2.4 东大梅花鹿1~7锯三杈鲜茸重统计

2.2.5 东大梅花鹿最佳生茸年龄及年龄范围

2.2.6 东大梅花鹿产茸量与年龄的关系

2.2.7 梅花鹿产茸性能估测

2.3 讨论

2.3.1 四平梅花鹿产茸性能分析

2.3.2 东大梅花鹿产茸性能分析

2.3.3 不同品种梅花鹿年龄与产茸量相关性分析

2.3.3 不同品种梅花鹿产茸性能差异分析

2.3.4 梅花鹿产茸性能估测

2.4 小结

第三章 梅花鹿产茸性状相关分子标记的筛选

3.1 试验材料

3.1.1 样品采集

3.1.2 试验主要试剂与仪器

3.2 试验方法

3.2.1 基因组DNA的提取

3.2.2 DNA的质量控制

3.2.3 MassARRAY?实验操作步骤

3.3 统计分析方法

3.3.1 群体遗传学研究方法

3.3.2 标记性状关联分析方法

3.3.3 标记对表型贡献率分析方法

3.4 结果与分析

3.4.1 基因组DNA提取结果

3.4.2 标记位点的SNP分型结果

3.4.3 群体遗传多样性分析

3.4.4 SNPs位点与产茸性状的关联性分析

3.4.5 关联显著SNPs的位置及部分最近基因分析

3.5 讨论

3.5.1 梅花鹿群体遗传多样性分析

3.5.2 SNPs与产茸性状关联分析

3.5.3 SNPs位置及部分最近基因功能探讨

3.6 小结

第四章 SNPs位点基因型组合的筛选及验证

4.1 试验材料

4.1.1 试验样品

4.1.2 主要仪器与试剂

4.2 试验方法

4.2.1 基因组DNA的提取

4.2.2 DNA质量检测

4.2.3 SNP分型检测

4.2.4 统计分析

4.3 试验结果

4.3.1 基因组DNA质量检测结果

4.3.2 SNPs位点基因型组合的筛选

4.3.3 不同类型基因型组合对产茸量的影响

4.3.4 SNPs位点基因型组合的验证

4.4 讨论

4.4.1 基因型组合分析的优势

4.4.2 基因型组合标记的验证

4.4.3 梅花鹿选种方案探讨

4.5 小结

第五章 结论

参考文献

附录A

附录B

致谢

作者简历