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【6h】

单家系2型神经纤维瘤病基因测序

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摘要

目的:
   对我院诊治的2型神经纤维瘤病家系病例资料(1996-2008)进行回顾性分析,采集外周血(9例正常,3例患者)及肿瘤石蜡标本(7块,3例患者)提取基因组DNA,应用测序仪(ABI3730XL)对NF2基因1-17外显子及其两端内含子直接测序,确定该家系NF2基因突变形式。
   方法:
   一.参照OMEGA公司提供的E.Z.N.A.石蜡组织基因组DNA纯化试剂盒(D3399-01)操作手册,提取外周血及石蜡标本基因组DNA,分光光度计测定(A260/A280)比值,据此估算提取产物DNA浓度。
   二.利用Primer5软件设计引物,1-17外显子及其两端部分内含子,引物合成由上海基康生物有限公司完成。外周血及石蜡标本均才用巢式PCR进行扩增,产物进行凝胶电泳,初步判断扩增效率,逐步优化反应条件。
   三.PCR产物经凝胶电泳证实为单一条带后,足量PCR产物送至上海桑尼公司及申速生物技术有限公司直接测序,测序方法为Sanger末端终止法测序。测序结果分析,利用DNAMAN、Chromas软件将测序结果与GenBank:AF165426.1提供NF2基因序列进行比对,确定其突变形式。
   结果:
   OMEGA公司(D3399-01(50 Preps))DNA提取试剂盒,可以同时抽取外周血及石蜡标本基因组DNA,采用巢式PCR可以获得特异性单一条带。上海申速及桑尼公司测序,B1、B3、B9外周血样本及(4/7)肿瘤样本NF2基因,exon14与内含子14交界处第一个碱基位置,即剪接供体位点GT→CT杂合性碱基突变,在正常受试者同位点未见异常。
   结论:
   外周血样本B1、B3、B9及部分肿瘤组织(4/7)NF2基因,exon14与内含子14交界处第一个内含子位置,剪接供体位点GT→CT杂合性碱基突变。依据“GT-AG”法则,剪接供体位突变后,导致内含子部分不能正常切除,异常形成,最终导致merlin蛋白截短表达,失去正常的肿瘤抑制功能。回顾性分析该家系病例资料发现,具有相同基因型患者其表现型之间也可存在差异,该致病性突变在家系内稳定遗传。

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