人类肿瘤辐射敏感数据库构建及功能因子的筛选研究

目录

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摘要

第1章绪论

1．1．1 全球癌症现状

1．1．2 癌症治疗的发展

1．1．3 放射治疗的基本原理及应用

1．2 精准医学背景下的放射生物学

1．2．1精准放疗的主要的策略

1．2．2 肿瘤辐射敏感性主要研究方向

1．3 肿瘤辐射敏感与系统生物学

1．3．1 系统生物学概述

1．3．2 基于生物网络的辐射基因筛选策略

1．3．3 基于多重药理学的增敏剂筛选策略

1．4肿瘤辐射敏感标志物

1．4．1 免疫浸润细胞在标志物研究中的潜在价值

1．4．2 可变剪接在标志物研究中的潜在价值

1．5主要研究内容及意义

第2章人类肿瘤辐射敏感数据库的构建

2．1引言

2．2．1数据收集及网站开发

2．2．2 数据分析及可视化

2．3 实验结果

2．3．1 辐射敏感相关数据的统计

2．3．2 数据库主要页面及功能

2．3．3 肿瘤辐射敏感关键信号通路

2．3．4 肿瘤辐射敏感相关的原癌基因和抑癌基因

2．3．5 广谱肿瘤辐射敏感基因

2．4 讨论

2．5 本章小结

第3章基于dbCRSR的潜在调控因子筛选研究

3．1 引言

3．2实验材料及方法

3．2．1 基因数据集的获取

3．2．2 基因间的互作关系的计算

3．2．3 MCODE子网络提取

3．2．4 基因功能的验证

3．2．5药物-靶点数据的获取

3．2．6 多靶点药物Brigtinib的筛选

3．2．7 Brigtinib辐射增敏作用的验证

3．2．8 miRNAs-靶基因数据

3．2．9 miRNA-辐射敏感调控网络的构建

3．3 结果

3．3．1 结直肠癌辐射敏感调控基因网络

3．3．2 CDC20基因辐射增敏功能的验证

3．3．3 药物-辐射敏感基因调控网络

3．3．4 多靶点药物Brigtinib的筛选及辐射增敏功能验证

3．3．5 miRNAs-靶基因辐射敏感调控网络

3．3．6 多靶点辐射增敏miRNAs的筛选

3．3．7 广谱辐射增敏能力的多靶点miRNAs

3．4 讨论

3．5 本章小结

第4章肿瘤放疗预后新型标志物的筛选研究

4．1 引言

4．2实验材料及方法

4．2．1 TCGA数据资源下载与使用

4．2．2 临床样本的筛选

4．2．3 免疫浸润程度及免疫细胞组成的计算

4．2．4 生存分析

4．2．6 基于免疫浸润的预测模型构建过程

4．2．7 可变剪接数据下载

4．2．8 基于可变剪接的预测模型构建过程

4．3 实验结果

4．3．1 7种癌症患者放疗情况概述

4．3．2 免疫浸润与放疗预后的关系

4．3．3 免疫细胞种类与患者放疗预后

4．3．4 基于免疫浸润的乳腺癌患者的放疗敏感标志物

4．3．5 低级别胶质瘤可变剪接事件概述

4．3．6 放疗预后相关可变剪接体

4．3．7 功能差异的可变剪接体

4．3．8 基于可变剪接的预测模型

4．4 讨论

4．5 本章小结

第5章总结与展望

5．1 全文总结

5．2 工作展望

参考文献

致谢

在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果