造血干细胞移植患者中MLB2型星状病毒全基因组扩增和星状病毒进化研究

目录

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中英文缩略词表

1.前言

2.实验材料

2.1实验仪器

2.2实验试剂与耗材

2.3主要试剂配制

2.4生物软件

3实验方法

3.1样品收集

3.2高通量测序粪便样本处理

3.3病毒RNA提取

3.4测序样本的制备

3.5 Miseq高通量测序

3.6测序后的生物信息学分析

3.7HAstV-MLB2的拼接与验证

3.8HAstV-MLB2全基因组扩增

3.9 HAstV-MLB2全基因组确证

3.10 HAstV-MLB2-YJMGK的流行病学筛查

3.11系统发育树和进化分析

3.12贝叶斯线图

3.13遗传多样性

4.结果

4.1高通量测序结果分析

4.2HAstV-MLB2-YJMGK 全基因组分析

4.3HAstV-MLB2-YJMGK 的筛查

4.4系统发育和进化分析

4.5HAstV 种群数量贝叶斯线图

4.6遗传多样性

5.讨论

6.结论

参考文献

综述:人星状病毒研究进展

附录

致谢