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汉族人群干扰素调节因子3基因多态性及环境因素与系统性红斑狼疮的关联性研究

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摘要

目的:通过Taqman技术对汉族人群SLE家庭中IRF3基因3个SNP进行基因分型,探讨IRF3基因多态性对SLE易感性的影响,并以SLE患者的正常同胞为对照进行家系内病例对照研究分析可能的环境危险因素以及基因与环境之间的交互作用。由于家系内病例对照不能识别早期的共同暴露因素,故采用成组设计的病例对照研究方法,进一步分析SLE发病的可能环境危险因素。   方法:采用家系收集的方法收集171个家系,171例SLE确诊患者和329名家系成员的血标本和调查表资料,用盐析法提取基因组DNA,用荧光定量PCR技术(Taqman)进行SNPs检测,用FBAT软件进行家系关联性分析,探讨IRF3基因多态性与SLE的关系。采用家系内病例对照研究的设计,条件Logistic回归分析的方法分析SLE发病的环境危险因素和基因与环境因素的交互作用对SLE发病的影响。由于家系内病例对照的特点,分析同胞对之间共同的环境因素时存在偏倚,我们采用成组病例对照研究的方法和非条件Logistic回归模型进一步对SLE的发病的环境危险因素进行分析。   结果:所研究家系中,IRF3基因rs2304204位点的基因型AA,AG和 GG的频率分别为28.7%,58.6%和 12.7%;rs2304206位点的基因型CC,CT和TT的频率分别为34.4%,60.6%,5%;rs7251位点的基因的GG,CG,CC的频率分别为25.4%,67.2%,7.4%。单位点分析显示,在显性模型中,rs2304206位点T等位基因与SLE发病相关(Z=2.238,P=0.0025),但在附加模型及隐性模型中未见相关性。基因型分析显示,rs2304206的CT基因型和rs7251的CG基因型与SLE的发病相关(rs2304206:Z=3.107,P=0.001;rs7251:Z=2.407,P=0.0016)。家系内病例对照研究,单因素Logistic回归分析环境因素与SLE的关系得出,男性和女性相比,女性可能更容易患病[P=0.048,OR=0.357(0.129-0.992)],高噪声可能是SLE发病的危险因素[P=0.026,OR=3.541(1.160-10.808)],有过敏史和感染史的人,患SLE的风险增加[过敏史:P=0.006,OR=5.667(1.661-19.336);感染史:P=0.017,OR=65.289(2.118-2012.137)];多因素分析显示,在调整性别、过敏史、感染史等因素后,IRF3基因的rs2304206 SNP位点未进入模型,提示IRF3基因的rs2304206SNP位点可能不是SLE发病的独立危险因素;基因与环境的交互作用分析表明,过敏史*rs2304206和感染史*rs2304206进入模型,,提示过敏史和感染史与所选的候选基因之间存在正向交互作用。成组病例对照研究中,单因素Logistic回归分析环境因素与SLE的关系得出女性的患病风险比男性高[P=0.008,OR=0.515]、饮酒则是保护因素[P=0.000,OR=0.193]、高噪声是SLE的发病危险因素[P=0.006,OR=2.098]、有过敏史和感染史的人,患SLE的风险增加[过敏史:P=0.000,OR=2.238;感染史:P=0.000,OR=2.319]。纳入多因素模型分析后,饮酒、高噪音、过敏史、感染史依然有统计学意义。   结论:安徽籍汉族人群IRF3基因2304206位点可能与SLE的遗传易感性有关,多种环境因素与SLE发病相关,且IRF3基因的rs2304206位点基因多态性能增加有过敏史和感染史的个体发生SLE的危险。

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