第一章 绪论
1.1红景天植物的研究概况
1.1.1红景天的概述
1.1.2红景天的资源及研究现状
1.1.3红景天的化学成分
1.1.4红景天的药理活性及应用
1.1.5影响植物基因表达及代谢的因素
1.2内生真菌的研究概况
1.2.1内生真菌的概述
1.2.2内生真菌与植物的互作关系与作用
1.2.3内生真菌影响植物的作用机制
1.3转录组学简介及研究进展
1.3.3高通量测序在转录组学中的应用
1.4代谢组学简介及研究进展
1.4.1代谢组学定义
1.4.2代谢组学的分析方法
1.4.3代谢组学在微生物与植物互作中的应用
1.5多重组学在内生菌与植物互作研究中的应用与研究进展
1.6本课题研究内容及意义
1.6.1 研究内容
1.6.2 研究意义
第二章 在转录水平大花红景天对内生真菌的应答研究
2.1实验材料
2.1.1红景天组培苗
2.1.2 供试菌株
2.2实验仪器与试剂
2.3实验方法
2.3.1红景天组培苗与内生真菌共培养
2.3.2测序样品RNA提取、文库构建及测序
2.3.3转录组拼接
2.3.4基因聚类及功能注释和分类
2.3.5 差异表达基因分析
2.3.6 差异表达基因(DEGs)的qRT-PCR验证
2.3.7统计分析
2.4结果与分析
2.4.1测序数据的整理、过滤及质量评估
2.4.2转录本拼装与分析
2.4.3 Unigene功能注释
2.4.4All Unigene表达差异分析
2.4.5 DEGs的qRT-PCR验证
2.5 讨论
2.6 小结
第三章 大花红景天对内生真菌应答的代谢研究
3.1实验材料
3.2实验仪器
3.3实验方法
3.3.1红景天组培苗与内生真菌共培养
3.3.2样品前处理
3.3.3 代谢物LC-MS测定
3.3.4数据处理
3.4结果与分析
3.4.1 原始数据预处理
3.4.2 多元统计分析
3.4.3 差异代谢物的筛选及鉴定
3.4.4 差异代谢物的代谢途径分析
3.4.5 转录组与代谢组结合分析
3.5 讨论
3.6 小结
第四章 结论与展望
4.1 结论
4.2 问题与展望
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简况及联系方式
承诺书
声明
