声明
符号说明
第一章 前言
1.1 木本植物病毒病害及病毒检测概况
1.2二代测序技术在检测木本植物病毒的应用
1.3油茶及病毒病害发生特点
1.4 Deltapartivirus病毒生物学和分子特性
1.4.1分类地位
1.4.2生物学特征
1.4.3基因组结构
1.5 双生病毒科的生物学和分子特性
1.5.1分类地位
1.5.2生物学特征
1.5.3基因组结构
2研究意义
3研究技术路线
第二章 油茶转录组测序
2.1实验材料
2.1.1采摘时间
2.1.2采摘地点
2.1.3实验试剂及仪器
2.2实验方法
2.2.1总核酸的提取
2.2.2高通量测序
2.3实验结果
2.3.1样本症状
2.3.2 油茶总RNA提取结果
2.3.3生物信息学分析
2.4讨论
2.5小结
第三章 油茶Deltapartivirus病毒基因组全序列克隆及分析
3.1实验材料
3.1.3实验主要仪器
3.1.4实验主要试剂
3.1.5实验主要分析软件
3.2实验方法
3.2.1油茶叶片总RNA的提取
3.2.2 RT-PCR扩增
3.2.3 PCR产物纯化
3.2.4 制备大肠杆菌感受态
3.2.5 连接，转化，测序
3.2.6 5’RACE
3.2.7 3’RACE
3.2.8 油茶Deltapartivirus序列比对及系统发育树构建
3.2.9田间筛查
3.2.10指示植物测定
3.3结果与分析
3.3.1 油茶总核酸提取结果
3.3.2 油茶Deltapartivirus病毒全序列扩增
3.3.3 油茶Deltapartivirus病毒的基因组结构
3.3.4 油茶Deltapartivirus 病毒的系统进化分析
3.3.5油茶Deltapartivirus田间筛查
3.3.6 指示植物检测
3.4讨论
3.5小结
第四章 油茶双生病毒基因组全序列克隆及分子特性分析
4.1实验材料
4.1.1实验试剂及仪器
4.2实验方法
4.2.1油茶总核酸的提取
4.2.2引物设计
4.2.3 PCR产物纯化
4.2.4连接，转化
4.2.5 阳性质粒鉴定与测序
4.2.6 田间筛查
4.2.7指示植物检测和种子传毒检测
4.3结果与分析
4.3.1油茶总核酸提取结果
4.3.2 油茶双生病毒全序列扩增
4.3.3 油茶双生病毒开放阅读框分析
4.3.4 油茶双生病毒的系统发育分析
4.3.5油茶双生病毒田间筛查
4.3.6油茶双生病毒指示植物检测和种子传毒检测
4.4 讨论
4.5小结
第五章 创新点及展望
5.1创新点
5.2展望
参考文献
致谢
硕士阶段科研成果
附表
常用试剂配方
