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吉林人参Dof基因家族的系统分析及PgDof14-1和PgDof26-5基因功能的初步研究

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第一章 前 言

1.1 人参概述

1.2 人参皂苷

1.2.1 人参皂苷研究进展

1.3 人参发状根

1.4 Dof转录因子

1.4.1 Dof蛋白在植物中的数量

1.4.2 Dof蛋白的结构特征

1.4.3 Dof蛋白的进化

1.4.4 Dof蛋白在植物中的调控作用

1.5 Dof 蛋白参与植物的抗冷胁迫

1.6 目的与意义

第二章 材料与方法

2.1 实验材料

2.1.1 数据来源

2.1.2 材料

2.2 仪器和软件

2.2.1 数据分析软件

2.2.2 实验仪器

2.3 实验方法

2.3.1 PgDofs的生物信息学分析

2.3.2 候选基因的生物信息学

2.3.3 目的基因的克隆

2.3.4 pBI121表达载体及遗传转化工程菌的构建

2.3.5 冷胁迫处理对候选基因的表达活动规律

2.3.6 拟南芥的遗传转化

2.3.7人参的遗传转化

第三章 结果与分析

3.1 PgDofs的生物信息学

3.1.1 PgDofs的筛选与合并

3.1.2 PgDofs的GO功能注释分析

3.1.3 PgDofs的保守结构域和进化分析

3.1.4 PgDofs的表达分析

3.1.5 3PgDofs在4个年生中的表达量分析

3.1.6 与人参皂苷含量高度相关基因的挖掘

3.1.7 PgDofs的SNP分析

3.1.8 具有SNP的PgDofs与关键酶基因的Heatmap分析

3.2 PgDof14-1、PgDof26-5基因的生物信息学分析

3.2.1 PgDof14-1、PgDof26-5蛋白质理化性质分析

3.2.2 PgDof14-1、PgDof26-5蛋白二级结构预测

3.2.3 PgDof14-1、PgDof26-5蛋白三级结构预测

3.2.4 PgDof14-1、PgDof26-5蛋白质磷酸化位点预测

3.2.5 PgDof14-1、PgDof26-5蛋白质信号肽预测及亚细胞定位

3.3 目的基因的克隆及表达载体的构建

3.4 冷胁迫处理下候选基因的表达分析

3.5 拟南芥的遗传转化

3.5.1 抗性植株筛选及PgDof14-1、PgDof26-5基因的检测

3.5.2 T2代植株的表型分析

3.5.2 T3代植株的叶绿素含量测定

3.6 人参幼苗的遗传转化及检测

3.6.1 人参幼苗的遗传转化

3.6.2 发状根阳性植株DNA提取及PgDof14-1和PgDof26-5基因PCR检测

第四章 讨 论

4.1 PgDofs的生物信息学分析

4.1.1 PgDofs的挖掘

4.1.3 PgDofs的进化分析

4.1.3 PgDofs的表达分析

4.1.4 PgDofs与皂苷含量的相关性分析

4.2 PgDof14-1和PgDof26-5的生物信息学分析

4.3 冷胁迫处理下候选基因的表达分析

4.4 PgDof14-1、PgDof26-5基因转化拟南芥的研究

4.5 PgDof14-1、PgDof26-5基因转化人参幼苗的研究

第五章 结 论

参考文献

附录

附表1PgDofs与人参皂苷含量的显著性分析

附表2PgDofs与关键酶基因表达量的显著性分析

附表3 PgDofs的SNP与皂苷含量的显著性分析

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