北京鸭A-FABP、PRLR基因多态性及其与生产性状的关联分析

摘要

本研究采用PCR-SSCP和DNA测序技术，检测了北京鸭和樱桃谷鸭4个群体共400个个体与脂肪性状相关基因(A-FABP基因)、北京鸭2个群体共238个个体与繁殖性状相关基因(PRLR基因)的遗传变异，分析了其遗传结构和遗传多样性，并对北京鸭和樱桃谷鸭4个群体在上述基因位点的多态性与其相关生产性状进行了关联分析，以期发现对重要经济性状具有显著效应的遗传标记，为中国地方鸭的高效选育和分子标记数据库的建立、种质资源保存与利用提供遗传学依据。本研究取得了以下结果： 1、肉鸭A-FABP基因多态性及其与屠体性状的关联分析 (1)进行A-FABP基因SNPs分析发现，所检测的A1位点未发现多态，A2位点发现6个SNPs(EU306610和EU306611：g．106A>T、108T>C、123T>C、164C>T、215C>A和231T>C)，均位于内含子2上。 (2)群体遗传学分析结果表明，群体基因型频率和基因频率有差异。四个群体A等位基因频率均高于B等位基因频率，并且在Z4和Z2中达到显著水平。 (3)适合性X2检验结果表明，北京鸭Z4、Z4×Z2杂交和樱桃谷鸭群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)，而北京鸭Z2群体处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P<0.05)，四个群体平均杂合度为0.42，平均多态信息含量为0.33，均为中度多态(0.25

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前言

第一章文献综述

1.1北京鸭和樱桃谷鸭介绍

1.1.1北京鸭

1.1.2樱桃谷鸭

1.2 SNP技术的发展与PCR-SSCP方法

1.2.1 SNP技术在基因组研究中的地位和意义

1.2.2 SNPs检测技术的发展现状

1.2.3 SNPs研究中存在的问题

1.2.4 PCR-SSCP方法的原理

1.2.5影响SSCP检测效率的因素

1.2.6 PCR-SSCP技术在动物遗传变异研究中的应用前景

1.3候选基因的选择

1.4脂肪酸结合蛋白研究概况

1.4.1脂肪酸结合蛋白的特征及分类

1.4.2脂肪酸结合蛋白的结构

1.4.3脂肪酸结合蛋白的结合机制及功能

1.4.4脂肪酸结合蛋白与脂肪酸的关系

1.4.5脂肪酸结合蛋白家族的研究进展

1.4.6脂肪型脂肪酸结合蛋白基因(A-FABP基因)

1.5催乳素和催乳素受体研究概况

1.5.1催乳素和催乳素受体一般结构和特征

1.5.2催乳素受体的剪接多样性和组织特异性表达

1.5.3催乳素受体的定位

1.5.4催乳素受体介导的信号传导途径

1.5.5催乳素受体的多态性研究

1.6研究的目的和意义

第二章屠体性能指标与胸肌肌内脂肪含量的测定

2.1材料与方法

2.1.1材料

2.1.2方法

2.2结果与分析

2.2.1北京鸭3个品系、樱桃谷鸭屠体性能与肌内脂肪含量的比较结果

第三章北京鸭A-FABP基因多态性及其与屠体性状的关联分析

3.1材料与方法

3.1.1材料

3.1.2试验方法

3.2结果

3.2.1 PCR产物扩增片段

3.2.2 PCR-SSCP结果

3.2.3回收测序

3.2.4统计分析

第四章北京鸭PRLR基因多态性及其与产蛋性能的关联分析

4.1材料与方法

4.1.1材料

4.1.2研究方法

4.1.3 PCR产物检测、变性及PAGE和SSCP图像分析

4.1.4北京鸭PRLR基因序列测定及DNA序列分析

4.2结果和分析

4.2.1 PCR产物的电泳检测

4.2.2 PCR-SSCP分析

4.2.3 PRLR基因突变与产蛋性能的关联分析

第五章讨论

5.1关于候选基因法

5.2关于抽样与样本含量

5.3关于PCR扩增效率

5.4关于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测效率

5.5关于饲养试验

5.6关于基因多态性

5.6.1北京鸭、樱桃谷鸭A-FABP基因多态性的研究

5.6.2北京鸭PRLR基因多态性的研究

5.7 SNP与生产性状的关联分析

5.7.1北京鸭、樱桃谷鸭A-FABP基因多态性与屠体性状的关联分析

5.7.2北京鸭PRLR基因多态性与产蛋性能的关联分析

第六章结论

6.1屠体性能指标与胸肌肌内脂肪含量的测定

6.2北京鸭A-FABP基因多态性与屠体性状的关联分析

6.3北京鸭PRLR基因多态性与产蛋性能的关联分析

参考文献

致谢

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