声明
摘要
第1章 绪论
1.1 生物序列分析的背景及研究现状
1.2 生物序列图形表示的研究概况
1.2.1 DNA序列的图形表示
1.2.2 蛋白质序列的图形表示
1.3 本文的主要工作
第2章 基于三种重要理化性质的蛋白质序列的3-D图形表示及其应用
2.1 引言
2.2 蛋白质序列的3维空间表示
2.2.1 氨基酸的几个重要理化性质参数和生物学特性
2.2.2 基于氨基酸理化性质的3维图形表示
2.3 图形的刻画方法及序列相似性
2.3.1 主惯性矩
2.3.2 不同坐标方向极差
2.3.3 九个物种ND5蛋白质序列的相似性分析
2.3.4 构建进化树
2.4 小结
第3章 一种基于序列片段方法的蛋白质相似性分析
3.1 引言
3.2 蛋白质序列的2维空间表示
3.2.1 基于两种氨基酸理化性质的2维图形表示
3.2.2 12种杆状病毒解旋酶蛋白质的图形表示
3.3 图形的刻画方法及序列相似性
3.3.1 图形几何中心
3.3.2 序列片段方法
3.3.3 12种解旋酶蛋白质相似性分析
3.3.4 图形比对
3.4 小结
第4章 一种基于统计方法的蛋白质相似性分析
4.1 引言
4.2 统计方法的描述
4.2.1 氨基酸的6种重要理化性质
4.2.2 0-1序列对应的统计方法及序列的数值刻画
4.3 蛋白质序列的相似性、差异性分析
4.4 结论
参考文献
致谢
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