北美圆叶菝葜和沃氏菝葜的比较亲缘地理学研究

目录

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论文说明

摘要

第一章前言

1．1．2圆叶菝葜和沃氏菝葜的研究概况

1．2亲缘地理学研究进展

1．2．1亲缘地理学概述

1．2．2亲缘地理学相关的遗传标记

1．3北美地区亲缘地理学研究现状

1．3．1北美植物区系的演变和发展

1．3．2北美植物区系起源的植物亲缘地理学研究

1．4比较叶绿体基因组学

1．5研究目的与意义

第二章基于微卫星标记的圆叶菝葜和沃氏菝葜的群体遗传多样性和遗传结构

2．1材料和试剂

2．1．1实验材料

2．1．2试剂配制

2．2微卫星引物设计

2．2．1基因组DNA提取

2．2．2 SSR引物设计与筛选

2．3基于微卫星标记的群体遗传学

2．4实验结果

2．4．1微卫星标记开发

2．4．2基于微卫星标记的群体遗传学

2．4讨论

第三章基于SSR的圆叶菝葜和沃氏菝葜群体亲缘地理模型分析(DIY-ABC)

3．1数据输入

3．2模型构建

3．3 DIY-ABC分析

3．3．1参数设置

3．3．2模型选择

3．3．3参数估计

3．4．1模型构建

3．4．2模型检验

3．4．3参数估计

3．5分析讨论

第四章基于叶绿体基因组的圆叶菝葜和沃氏菝葜的系统发育分析与分歧时间估算

4．1实验材料

4．2实验方法

4．2．1基因组DNA提取及叶绿体基因组送测

4．2．2圆叶菝葜和沃氏菝葜叶绿体基因组组装与注释

4．2．3圆叶菝葜和沃氏菝葜叶绿体基因组比较

4．2．4圆叶菝葜和沃氏菝葜叶分歧时间估算

4．3实验结果

4．3．2叶绿体基因组比较分析

4．3．3分歧时间估算

4．4分析与讨论

第五章基于ENM模型的圆叶菝葜和沃氏菝葜分布区模拟

5．1研究方法

5．1．1圆叶菝葜和沃氏菝葜分布位点信息获取

5．1．2气候图层的获取

5．1．3生态位模拟

5．1．4适生区范围比较分析

5．2结果

5．3分析与讨论

第六章总结与展望

参考文献

研究成果

致谢