浙江几种常见刺胞动物的18S rRNA和Cyt b基因序列测定和分析

摘要

刺胞动物门(Cnidaria)虽然仅两胚层，组织分化尚处于原始阶段，但在动物演化上具有十分重要意义。随着刺胞动物在医学领域研究的深入和其广阔的应用前景，刺胞动物日益受到重视。动物资源的利用，离不开分类学这一基础学科，同时，应用研究也对分类学提出了更高的要求。因此，刺胞动物分类学研究越来越受到关注，已成为无脊椎动物分类学新的研究热点之一。 刺胞动物纲(Class)的分类，依据群落形态、触手类型和数量、骨骼结构、消化腔内隔膜的数量、分隔状态以及生活史，把其分为水螅纲(Hydrozoa)、钵水母纲(Scyphozoa)和珊瑚纲(Anthozoa)。然而，纲以下目(Order)、科(Family)的分类，不同学者之间有较大分歧，现有的形态分类系统很难反映不同科及物种之间的进化关系，但分子生物学技术为刺胞动物自然分类系统的确立，提供了至关重要的技术保障。本文选择小核糖体RNA(18SrRNA)和线粒体细胞色素b(Cytb)基因为分子标记，对浙江常见刺胞动物进行了序列测定和分析，并用Kimura2-parameter算法建立了NJ和MP模型分子系统树，在分子水平上确定了它们的分类定位。主要结论如下： (1)平洋银币水母(Porpitaporpita)的18SrRNA基因序列与GeneBank已登陆的一未定种银币水母(Porpitasp.，AF358086)的序列相似度高达99.8％；以NJ和MP法建立的分子系统树显示出两种银币水母既不属管水母目(Siphonophora)，也不属漂浮水母目(Chondrophora)，研究结果支持将银币水母列在花水母目(Anthomedusae)的观点。 (2)产于象山和宁海的纵条矶海葵(Haliplanellaluciae)18SrRNA基因序列与GeneBank登录的纵条矶海葵(AJ133554)序列相似性达99％。NJ法和MP法建立的分子系统树表明，纵条矶海葵的分类地位与传统分类学相一致。 (3)红海葵(Actiniidaeactiniaequina)、黄侧花海葵(Anthopleuraxanthogrammica)及绿疣海葵(Anthopleuramidori)的Cytb基因部分序列(1Kb左右)经比对，3种海葵与已知的海葵科物种羽毛状海葵(Metridiumsenile，AF000023)的Cytb基因序列相似性分别达均为88％、87.6％和86.9％。NJ法和MP法建立的分子系统树显示，3种海葵也与海葵科物种首先聚支，属于同一分类单元。此与传统分类学一致。(4)星虫状海葵(Edwardsiasipunculoides)现有分类地位，属于爱氏海葵科，但基于18SrRNA和Cytb基因序列分析上建立的分子系统树(NJ和MP)上均显示，该物种与海葵科物种首先聚支。因此，星虫状海葵不应再置于爱氏海葵科之中。 (5)刺胞动物是粘多糖含量较多的物种，提取其DNA时，采用CTAB法效果较为理想，PCR体系选择较高镁离子浓度(2.5mM)为宜。 综上所述，18SrRNA和Cytb两种基因能用于分类鉴定，其中Cytb基因能更好的验证较低分类单元的种属关系。通过浙江常见几种刺胞动物的18SrRNA和Cytb基因序列测定和分析，太平洋银币水母应调整到花水母目，星虫状海葵应调整到海葵科。

目录

致谢

英文文摘

图表目录

1.刺胞动物分子生物学研究概况

2.几种水母与海葵的18S rRNA 序列测定和分析

3.海葵线粒体 cyt b基因序列测定和分析

4.结论

参考文献