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粪菌移植缓解仔猪肠上皮损伤和调节肠道菌群代谢的研究

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摘要

1前言

1.1肠道菌群及其代谢功能

1.2菌群代谢物对肠屏障的调节

1.3粪菌移植技术及其研究进展

1.4仔猪免疫应激模型及其应用

1.5研究目的与意义

2材料与方法

2.1试验材料

2.2.2仔猪免疫应激模型的建立

2.2.3屠宰试验

2.2.4样品采集与保存

2.3指标测定

2.3.1生长性能和腹泻率测定

2.3.2肠道光镜切片制作与观察

2.3.3肠道电镜切片制作与观察

2.3.4实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测mRNA相对表达量

2.3.5 Western Blot检测目标蛋白相对表达量

2.3.6肠道上皮细胞增殖和凋亡检测

2.3.7免疫荧光法检测肠上皮细胞连接蛋白表达

2.3.8肠道菌群16S rDNA测序

2.3.9肠道内容物代谢组学分析

2.4数据处理与分析

3结果与分析

3.1仔猪增重和腹泻率

3.2肠道菌群多样性和组成分析

3.2.1肠道菌群α多样性

3.2.2肠道菌群β多样性

3.2.3肠道菌群组成差异

3.2.4肠道菌群结构变化

3.3肠道形态和肠黏膜屏障变化

3.3.1肠道形态

3.3.2肠上皮细胞增殖和凋亡

3.3.3肠上皮细胞连接蛋白表达

3.3.4肠黏膜细胞因子表达

3.4肠道菌群代谢及黏膜相关基因表达变化

3.4.1非靶向代谢组学分析

3.4.2靶向代谢组学分析

3.4.3肠黏膜相关基因表达

3.5肠道菌群功能预测分析

3.5.1主成分分析

3.5.2差异功能分析

3.6菌群代谢物下游通路变化

4讨论

4.1粪菌移植对仔猪增重与腹泻的影响

4.2粪菌移植对肠道菌群多样性和组成的影响

4.3粪菌移植对肠上皮损伤的缓解作用

4.4粪菌移植对肠道菌群代谢功能的影响

4.5粪菌移植对菌群代谢物下游通路的影响

5小结与创新点

5.1小结

5.2创新点

参考文献

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