新疆维吾尔族及汉族乙型肝炎病毒感染与HLA-DP单核苷酸多态性的相关性研究

摘要

目的：通过检测候选基因HLA-DP rs3077、rs2301220、rs3135021、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277535、rs9277471八个位点单核苷酸多态性，探讨新疆维吾尔族、汉族HLA-DP SNPs与慢性乙型肝炎病毒感染的相关性；探讨HLA-DP基因单核苷酸多态性是否影响维、汉两民族之间 HBV感染的个体差异。为临床诊断、治疗及预后提供以分子学水平为指标的遗传学参考依据。
　　方法：收集新疆医科大学中医医院、库尔勒维吾尔医院的住院和门诊患者以及体检人员作为受试者。所收样本分为维族、汉族慢性乙肝患者；维族、汉族健康者共四组，每组人数均等。采用1:1病例-对照研究，病例组为慢性乙肝患者，对照组为体检健康人群。1、使用DNA提取试剂盒提取标本基因组DNA并进行质检。2、用SNapshot方法对HLA-DP基因rs3077、rs2301220、rs3135021、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277535、rs9277471的八个位点进行检测及分型。3、统计分析采用SAS9.3。研究中所获得的数据，年龄采用均数和标准差表示，基因型频率和等位基因频率采用构成比或绝对数描述，先对维吾尔族与汉族之间进行 Hardy-Weinberg平衡检验，乙肝组和非乙肝组之间基因多态性的差异采用χ2检验，分别以疾病、性别作为分层因素比较汉族和维吾尔族之间、乙肝非乙肝之间基因多态性的差异采用Cochran-Mantel-Haenselχ2检验，不同基因型和有无乙肝之间的多因素分析采用Logistic回归，检验水准α=0.05，1-β=0.8。
　　结果：1、在 HBV+组和健康对照组比较中 rs3077（χ2=8.323,P=0.0156）、rs2301220（χ2=9.470, P=0.0088）、rs9277341（χ2=11.923, P=0.0026）这三个位点的P值均小于0.05，具有统计学意义，故其位点多态性与HBV感染相关。2、在汉族HBV+与对照组比较时，rs3077（χ2汉HBV vs对照=9.313, P=0.0095）、rs2301220（χ2汉HBV vs对照=9.566, P=0.0084）、rs9277341（χ2汉HBV vs对照=13.096, P=0.0014）三个位点的P值均小于0.05，具有统计学意义。3、在汉族健康对照组与维吾尔族健康对照组比较，rs3077（χ2对照汉vs维=28.096, P＜0.0001、rs2301220（χ2对照汉vs维=21.637, P＜0.0001）、rs9277341（χ2对照汉vs维=24.467, P＜0.0001）、rs9277378（χ2对照汉vs维=16.695, P=0.0002）、rs9277471（χ2对照汉vs维=14.946, P=0.0006）、rs9277542（χ2对照汉vs维=16.074P=0.0003）、rs9277535（χ2对照汉vs维=18.645，P<0.0001）这七个位点的单碱基分型具有统计学意义。4、汉族 HBV+和维吾尔族 HBV+比较，rs3077（χ2HBV汉vs维=45.675, P＜0.0001）、rs2301220（χ2HBV汉vs维=38.934, P＜0.0001）、rs9277341（χ2HBV汉vs维=47.344, P＜0.0001）、rs9277378（χ2HBV汉vs维=26.661, P＜0.0001）、rs9277542（χ2HBV汉vs维=24.309, P＜0.0001）、rs9277471（χ2HBV汉vs维=29.360, P＜0.0001χ2对照汉vs维）这六个位点中单核苷酸多态性分型具有统计学意义。5、在性别与乙型肝炎病毒感染的相关性研究中发现健康对照组rs9277341（χ2对照男vs女=9.271, P=0.0097）、rs9277378、（χ2对照男vs女=7.936, P=0.0189）、rs9277542（χ2对照男vs女=8.364, P=0.0153）、rs9277471（χ2对照男vs女=8.194, P=0.0166）四个位点的单碱基分型是具有统计学意义的。
　　结论:1、HLA-DP SNP与乙型肝炎病毒感染的关系，rs3077、rs2301220、rs9277341的三个位点与乙型肝炎病毒感染相关，其中 rs3077GG、rs2301220TT、rs9277341CC基因型可能增加乙型肝炎感染的风险。2、汉族健康对照组和维吾尔族健康对照组比较，发现 rs3077、rs2301220、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277471这六个基因位点具有统计学意义。其中rs3077AA、rs2301220CC、rs9277341TT、rs9277378AA、rs9277542TT、rs9277471GG基因型有可能降低乙型肝炎病毒感染的可能性。3、男女性别差异与乙肝病毒感染的关系，rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277471四个位点可能与发病人群中的那女性别差异相关。rs9277341CC、rs9277378GA、rs9277378GG、rs9277542CC基因型有可能增加乙型肝炎感染的风险。4、HLA-DP基因的基因频率是存在民族差异的，HLA-DP基因的rs3077、rs2301220、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277535、rs9277471的七个位点中不同基因A、G、C、T的数目和基因频率在维吾尔族与汉族中存在显著差异，而 rs3135021的两种等位基因A、G的数目和频率在两民族之间无统计学意义。

目录

封面

声明

中英文缩略词对照表

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中文摘要

英文摘要

前言

内容与方法

1 研究对象

2 研究方法

3 实验方法

4 质量控制

5 统计方法

6 技术路线图

结果

1 临床病例基本资料分析

2 基因位点分型结果

3 Hardy-Weinberg平衡

4 汉族和维吾尔族等位基因分布

5 HLA-DP SNP与HBV感染的关系

6 维吾尔族及汉族HBV感染、对照组与HLA-DP SNP的关系6.1 汉族HBV+和对照组比较

7 乙型肝炎病毒感染在性别上的差异与 HLA-DP 基因单碱基分型的相关性

8 HLA-DP基因单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒感染的关联分析

讨论

1慢性乙型肝炎病毒的感染机制

2 HLA与疾病的关系

3 SNP与疾病的关系

4 HLA-DP基因多态性与乙型肝炎病毒感染的相关性

5 乙型肝炎病毒感染的性别差异

6 非经典HLA分子与乙型肝炎病毒感染的关系

7 问题与展望

小结

致谢

参考文献

附录1

综述：HLA-Ⅱ类基因SNP与慢性乙型肝炎病毒感染的关系

攻读硕士学位期间发表的学术论文

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