声明
摘要
第1章 绪论
1.1 增强子
1.1.1 增强子结构与功能
1.1.2 表观遗传学特征与增强子
1.2 增强子RNA
1.2.1 增强子对RNA的定义
1.2.2 增强子RNA的特征及其他转录单元
1.2.3 增强子RNA的功能
1.3 增强子转录与疾病
1.3.1 增强子RNA、R-loop和基因组稳定性
1.3.1 增强子突变
1.4 本课题创新点
第2章 10个组织中增强子的识别及组织特异性分析
2.1 材料与方法
2.1.1 人10个组织组蛋白修饰数据及其他数据来源
2.1.2 各个组织增强子的识别
2.1.3 EnhTS、EnhUE、EnhOth的识别
2.1.4 Enh2D-eRNA、Enh1D-eRNA、Enhno-eRNA的识别
2.1.5 增强子对RNA表达量分析与注释
2.1.6 增强子保守性与motif分析
2.1.7 增强子GC含量分析
2.1.8 组织特异性转录因子识别
2.1.9 增强子上转录因子结合位点识别
2.1.10 增强子靶基因表达量及特异性
2.1.11 增强子突变位点的识别
2.2 结果与分析
2.2.1 人10个组织中增强子识别
2.2.2 增强子RNA的识别及增强子分类
2.2.3 10个组织中增强子保守性分析
2.2.4 10个组织中增强子GC含量分析
2.2.5 转录因子在10个组织中增强子上的富集分析
2.2.6 10个组织中增强子突变分析
2.2.7 10个组织中增强子靶基因预测及分析
2.2.8 10个组织中增强子及其靶基因功能分析
2.2.9 组织特异性增强子-转录因子-靶基因调控网络
2.2.10 人组织特异性增强子数据库构建
第3章 A549和NHLF中增强子识别及差异分析
3.1 材料与方法
3.1.1 A549和NHLF组蛋白修饰数据及其他数据来源
3.1.2 A549和NHLF中增强子的识别
3.1.3 A549和NHLF中EnheRNA、Enhno-eRNA的识别
3.1.4 A549和NHLF中增强子靶基因及差异表达分析
3.2 结果与分析
3.2.1 A549和NHLF中增强子识别
3.2.2 A549和NHLF中增强子RNA的识别及增强子分类
3.2.4 A549和NHLF中靶基因及功能分析
结论
致谢
参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文