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【6h】

CFH,C2,C3,CFB,SERPING1基因与老年黄斑变性相关性的研究

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论文说明:缩略词表、图表目录

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前言

1、总研究路线

2、对象与方法

2.1对象

2.1.1研究对象及纳入标准

2.1.2主要生化试剂

2.1.3试剂的配制

2.1.4主要仪器

2.2实验方法

2.2.1体格检查及临床生化指标检测

2.2.2全血DNA提取和标本处理

2.2.3 SNP位点的筛选

2.2.4 SNP位点的基因型检测

2.2.5质量控制

2.2.6结果处理

3结果与分析

3.1入选病例和对照的基本资料

3.2基因SNP位点的PCR扩增及电泳条件优化的结果

3.2.1 SERPING1基因6个SNP位点PCR条件优化结果

3.2.2 CFH基因7个SNP位点PCR条件优化结果

3.2.3 C2基因2个SNP位点PCR条件优化结果

3.2.4 C3基因2个SNP位点PCR条件优化结果

3.2.5 CHB基因2个SNP位点PCR条件优化结果

3.3基因与中国汉族人AMD关联性分析

3.3.1基因型结果和质量控制

3.3.2 SERPING1基因与AMD关联性分析

3.3.3 CFH基因与AMD关联性分析

3.3.4 C2,C3,CFB基因与AMD关联性分析

4讨论

4.1实验条件讨论

4.1.1标本来源和全血DNA提取

4.1.2 PCR引物设计条件探索的讨论

4.1.3 SNP技术的讨论

4.1.4 SNP结果和质量控制的讨论

4.2基因与AMD的关系的讨论

4.2.1 SERPING1基因与AMD的关系

4.2.2 CFH基因与AMD的关系

4.2.3 C2、CFB、C3基因与AMD的关系

5.小结

综述

1视觉和黄斑变性

2黄斑变性的危害

3老年黄斑变性

4老年黄斑变性研究进展

4.1已知遗传连锁位点

4.2候选基因

4.3多基因联合作用

5展望

参考文献

致谢

硕士期间发表论文情况

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摘要

目的:研究补体系统F(CFH)基因、补体系统C2基因、C3基因、补体因子B(CFB)基因、补体系统C1抑制因子(SERING1)基因是否与中国人老年黄斑变性(AMD)相关。
   方法:本研究在研究CFH、C2、CFB、C3基因SNP位点时,入选了中国汉族人干性AMD病人80例、中国汉族人湿性AMD病人158例和220例正常对照;在研究SERING1基因SNP位点时,入选了194例湿性AMD病人、78例干性AMD病人和285例正常对照。
   分别选取CFH基因的7个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs3753394、rs800292、rs1061170、rs7535263、rs2274700 rs1410996、rs1329428,C2基因中2个位点rs547154、rs9332739,C3基因中2个rs2230199、rs1047286,CFB基因中2个位点rs641153、rs4151667和SERING1基因中6个SNP位点rs2511990、rs1005510、rs11546660、rs2511989、rs2511988、rs4926采用单碱基延伸法对中国汉族人老年黄斑变性(age-related maculardegeneration,AMD)病人和正常对照进行基因型分析。
   通过病例对照研究在SPSS16.0上进行P值分析,然后用Haploview4.0进行单体型分析。
   结果:CFH基因的4个SNP位点rs3753394(P==0.0276)、rs800292(P=0.0266)、rs1061170(P=0.00514)、rs1329428(P=0.0089)与中国汉族湿性AMD显著相关,它们的单体型CATA是中国汉族人湿性AMD的保护因子,其P值为0.0005,OR值为0.29,95%可信区间为0.15-0.60,而CFH基因其它的3个SNP位点与中国汉族人AMD没有相关性。
   C2、C3、CFB基因的各2个SNP位点与中国汉族人干性或者湿性AMD均没有相关性。
   SPERING1基因的6个SNP位点中,没有与AMD有显著相关的位点。通过单体型研究,我们发现这6个位点的一个单体型TGTGCG与湿性AMD显著相关,其P值为0.0091,OR值为2.38,95%可信区间为1.20-4.74,是一种中国汉族人群湿性AMD的风险单体型。另一种单体型CGTGCA在中国汉族人群干性AMD和正常对照中也存在显著差异,其P值为0.0005,OR值为3.30,95%可信区间为1.6-6.59,单体型CGTGCA是中国汉族人干性AMD的一个风险单体型。

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