天府肉羊GH基因多态性及其与生长性状的关联性研究

摘要

本实验以四川农业大学新近选育成功的250只天府肉羊为试验材料，其中黑头羊41只（B）、红头羊137只（R），白头羊72只（W），采用PCR-SSCP方法检测生长激素基因（GH）外显子2、3、5区域的多态性及其与生长性状的相关性，结果表明： 3对引物的扩增片段均存在多态性，外显子2、3、5区域内各检测到1个变异位点，共计3个变异位点，分别为669bp、1057bp和1830bp处。669bp处为G→A的单碱基突变（Gly35Ser），1057bp处为G→A的单碱基突变（Gly89Ser），1830bp处T→C的单碱基突变。 669位点在天府肉羊群体中存在等位基因A和B，基因频率分别为0．534和0．466。有三种基因型：AA、AB和BB，基因频率分别为0．152、0．764和0．084。AB基因型的2月龄体重、6月龄体重和体长及周岁体高显著高于AA和BB型（P<0．05）；AB基因型的成年体重、体高、体长和胸围极显著高于AA和BB型（P<0．01）；AB基因型的周岁体重极显著高于BB型（P<0．01），显著高于AA型（P<0．05），AB型的周岁体长和胸围极显著高于AA型（P<0．01），显著高于BB型（P<0．05）。 1057位点在天府肉羊群体中存在等位基因C和D，基因频率分别为0．734和0．266。有三种基因型：CC、CD和DD，基因频率分别是0．652、0．184和0．164。CC基因型的成年体重极显著高于CD型和DD型（P<0．01），CC型和DD型的6月龄胸围极显著高于CD型（P<0．01）。 1830位点在天府肉羊群体中存在等位基因E和F，基因频率为0．722和0．278。有三种基因型：EE、EF和FF，基因型频率分别是0．64、0．164和0．196。EE基因型与FF基因型2月龄体长的差异不显著，均显著高于EF型（P<0．05）；FF型的2月龄胸围显著高于EF型（P<0．05），EE型与EF型和FF型的差异不显著（P<0．05）；EF型和FF型的周岁胸围差异不显著，均显著高于EE型（P<0．05）；EF型的成年胸围极显著高于EE型（P<0．01）。 R和W头系各阶段的体重差异不显著（P<0．05），均显著高于B头系（P<0．05）；其余生长性状差异不显著。 外显子2、3、5的多态信息含量分别为0．374，0．314和0．375，均为中度多态，表明以上三个位点在群体中有较高的遗传变异。3个位点的x2值检验均极显著的偏离了Hardy-Weinberg平衡状态（P<0．01）。

目录

文摘

英文文摘

声明

1 文献综述

1.1 概述

1.1.1 生长激素的发现和作用

1.1.2 生长激素（GH）的表达和调控

1.2 GH基因的研究进展

1.2.1 GH基因的结构、定位

1.2.2 GH基因在家畜上的研究与运用

1.3 现代分子遗传标记辅助育种（MASB）

1.4 本实验的理论依据

1.5 研究背景

1.6 本实验研究的目的和意义

2 材料与方法

2.1 试验材料

2.1.1 采集血样

2.1.2 主要仪器设备

2.1.3 引物合成

2.1.4 主要试剂及配制

2.2 试验方法

2.2.1 总DNA的提取

2.2.2 DNA浓度和纯度的检测

2.2.3 引物的设计与合成

2.2.4 PCR产物的检测

2.2.5 PCR扩增的PCR-SSCP分析及基因型判定

2.2.6 序列结果

2.3 数据处理与统计分析

3 试验结果

3.1 基因组DNA抽提结果

3.2 GH基因PCR扩增结果

3.3 PCR-SSCP多态性检测结果

3.4 GH 基因3'端部份序列测序结果

3.5 天府肉羊 GH 基因频率和基因型频率分析

3.5.1 669 位点的基因频率和基因型频率

3.5.2 1057 位点的基因频率和基因型频率

3.5.3 1830 位点的基因频率和基因型频率

3.5.4 群体的X2 检验、多态信息含量和杂合度及有效等位基因数

3.6 GH基因不同多态位点与天府肉羊生长性状的关联分析

3.6.1 669 位点不同基因型与生长性状的关联分析

3.6.2 位点1057 不同基因型与生长性状的关联分析

3.6.3 位点1830 不同基因型与生长性状的关联分析

3.7 不同头色与生长性状的关联分析

4 讨论

4.1 关于实验方法的优化

4.1.1 DNA抽提方法的优化

4.1.2 PCR-SSCP技术的优化

4.2 GH基因在天府肉羊中遗传特性的分析

4.3 天府肉羊GH基因核苷酸多态位点分析

4.4 GH基因对天府肉羊经济性状的影响

4.4.1 外显子2 多态位点各基因型与生长性状的关系

4.4.2 外显子3 多态位点各基因型与生长性状的关系

4.4.3外显子5 多态位点各基因型与生长性状的关系

4.5 不同头色群体羊之间的生长性状

4.6 天府肉羊群体遗传多样性

4.7 GH基因的应用前景

5 结论

参考文献

致谢