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中国刺胫弄蝶族(Baorini)分子系统发育研究

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目录

第一章 绪论

1.1.1 刺胫弄蝶族Baorini的形态特征

1.1.2 中国刺胫弄蝶族Baorini的种类和地理分布

1.1.3 形态分类学研究概况

1.1.4 系统发育研究概况

1.1.5 研究目的

1.2 分子系统学研究

1.2.1 分子系统学研究原理与方法

1.2.2 分子系统发育树的构建方法

第二章 中国刺胫弄蝶族(Baorini)分子系统发育研究

2.1 实验材料和方法

2.1.1 实验材料

2.1.2 实验方法

2.1.3 序列编辑和分析

2.2 实验结果

2.2.1 序列分析

2.2.2 碱基替换饱和效应的检验

2.2.3 邻接树(neighbor joining tree , NJ)

2.2.4贝叶斯树(bayesian inference, BI)

2.3 讨论

2.3.1 稻弄蝶属Parnara的分类地位

2.3.2 刺胫弄蝶属Baoris和谷弄蝶属Pelopidas的分类地位

2.3.3 孔弄蝶属Polytremis的分类地位

2.3.4 孔弄蝶属Polytremis、白斑弄蝶属Tsukiyamaia和珂弄蝶属Caltoris的亲缘关系

2.3.5 拟籼弄蝶属Pseudoborbo的有效性和分类地位

2.3.6 COI序列能否作为DNA条形码来鉴定该族物种

第三章 盒纹孔弄蝶指名亚种Polytremis theca theca和华东亚种Polytremis theca fukia的分类地位研究

3.1 实验材料与方法

3.1.1 实验材料

3.1.2 实验方法

3.2 统计分析

3.3 实验结果

3.3.1 遗传变异和单倍型网络

3.3.2 系统发育及种群结构分析

3.3.3 种群数量推断与分歧时间的估计

3.4 讨论

参考文献

攻读学位期间的论文著作

致谢

声明

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摘要

刺胫弄蝶族Baorini,隶属于鳞翅目Lepidoptera,弄蝶科Hesperiidae,弄蝶亚科Hesperiinae。该族是由美国鳞翅目研究学家Warren在2008年正式确立,模式属是刺胫弄蝶属Baoris。目前全世界已经记载13属97种,我国分布的有8属43种,其中13种为我国特有种。
  尽管有关刺胫弄蝶族的研究起步较早,但主要集中在形态学分类、区系分布和新种报道等方面。由于该族弄蝶种类外形相似,缺乏有效的形态学鉴别性状,使该族基于形态学建立的传统分类体系及类群间的系统发生关系还存在许多未解难题,该族类群的分类地位还存在较大争议。为了澄清我国刺胫弄蝶族弄蝶的系统发育关系,本文在形态学分类的基础上,利用分子生物学方法构建了中国刺胫弄蝶族的分子系统发育树,研究了线粒体及核基因的分子进化和变异特征。同时也深入探讨了盒纹孔弄蝶两亚种的分类地位,旨在为刺胫弄蝶族的系统发育研究提供参考。
  本研究选用了线粒体COI、COII和核基因28s rDNA的D3区,18s rDNA的V4、V7区部分序列对中国产刺胫弄蝶族弄蝶和两个外群的106个样本进行了检测,并利用ClustalX1.83、BioEdit v.7.0.5.3、Mega7.0等软件对所测的序列进行比对和特征分析,并采用邻接法(NJ)、贝叶斯推论法(BI)构建了刺胫弄蝶族的系统发育树。同时,还基于线粒体COI序列构建了刺胫弄蝶族的系统发育树,旨在探究COI序列能否作为DNA条形码用于该族弄蝶的分类鉴定。此外,还从生物地理学、遗传结构和系统发育关系上对盒纹孔弄蝶两亚种进行了深入研究,对两亚种的分类地位重新进行了评估。得到的主要结论如下:
  1.基于线粒体基因和核基因序列所构建的NJ树和BI树其拓扑结构基本一致,均分为五支。除了孔弄蝶属Polytremis是多系的以外,其它属都是单系的,每个属的物种都能很好的聚在一起。
  2.稻弄蝶属Parnara是单系的,并且是比较原始的类群。谷弄蝶属Pelopidas与刺胫弄蝶属Baoris是姐妹群,两者的亲缘关系较近。拟籼弄蝶属Pseudoborbo是从籼弄蝶属Borbo中分出的一个新属,两者的亲缘关系较近。
  3.白斑弄蝶属Tsukiyamaia、孔弄蝶属Polytremis和珂弄蝶属Caltoris三者的亲缘关系较近,且孔弄蝶属Polytremis与白斑弄蝶属Tsukiyamaia的亲缘关系比与珂弄蝶属Caltoris的近。
  4.本文利用DNA条形码成功鉴定出了刺胫弄蝶族Baorini的40个种,结果表明每个种的个体都能聚到一起,说明了本实验所扩增的COI片段能作为DNA条形码来鉴定该族弄蝶。
  5.盒纹孔弄蝶华东亚种(Polytremis theca fukia)和指名亚种(Polytremis theca theca)在地理分布、形态特征、遗传结构、分子系统发育上均存在显著差异,提议应将盒纹孔弄蝶两亚种提升为种。

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