应用EST分析和cDNA微阵杂交研究肝癌差异表达基因

摘要

肝癌严重威胁着人类的生命和健康,肝癌发生、发展过程中涉及到多种基因的变化.为了深入研究肝癌的发病机理,必须从大规模范围内研究基因在肝癌组织中的变化.在人类基因组计划中使用和成熟起来的EST分析和cDNA微阵杂交技术为实现这一目标提供了可能,应用这两种技术研究了肝癌组织中上调及下调表达的基因,获得了一些肝癌相关基因.

目录

文摘

英文文摘

前言]

第一部分 cDNA文库的建立和肝癌表达谱的基本特征

材料和方法

一、组织来源

二、总RNA的抽提和mRNA的纯化

三、cDNA文库的构建

四、DNA模板的制备及自动测序

五、数据收集和分析

六、基因功能分类

七、半定量RT-PCR

结果

一、文库情况介绍

二、肝癌和癌旁组织中各种类型基因的表达情况比较

三、半定量RT-PCR的结果

讨论

一、癌变后肝功能变化情况

二、基因表达上调或下调的原因

第一部分 参考文献

综述1 几种重要的肝癌相关基因及其作用

第二部分 应用cDNA微阵杂交研究肝癌差异表达基因

材料和方法

一、制备微阵点膜用线形DNA片段

二、纯化PCR产物

三、制备cDNA微阵杂交膜

四、杂交

五、使用磷屏探测放射性

结果

一、DNA陈列的质量鉴定

二、cDNA微阵杂交和EST测序分析所得到的一致结果

三、筛选出来的肝癌相关基因

讨论

一、筛选标准的依据和它的内容

二、有关基因的研究

第二部分 参考文献

综述2 微阵杂交的原理和应用

后记

致谢