甲型流感病毒H3抗原进化及变异规律研究

摘要

甲型流感病毒长期以来一直是威胁人类健康的重要病原体之一，对其变异规律进行深入的分析研究在流感的防治工作中具有重要的现实意义。本研究借助近年来发展起来的数据挖掘技术和进化树分析方法，从生物信息学的角度对流感病毒H3抗原的变异规律进行了系统研究，我们认为H3亚型流感病毒在人间的变异呈现出逐渐加速的趋势，而这主要是受到了越来越强大的免疫屏障的筛选作用所致。目前免疫策略的核心任务是保护高危人群，但是这种策略并不能够阻止，反而可能加速了新变异株的出现。通过更进一步的生物信息学分析，并且在全球采取统一的主动免疫策略，人类应当有可能消灭已有亚型病毒的继续流行。这将是一个异常艰巨，然而值得尝试的任务。而本研究提供的分析结果和具体建议则可作为防治工作的决策和实施之理论依据与参考。本研究在回答流行病学问题的同时，还系统完善了遗传序列变异规律研究的数据挖掘方法体系，提出了大数据集进行精确进化树分析的方法，分析结果显示这些方法能够很好的满足生物信息学中相应分析的需求，值得进一步加以推广和应用。

目录

前言

第一章数据的收集和预处理

1.1资料来源

1.2资料的预分析

1.3讨论及小结

第二章H3序列基本变异规律的数据挖掘分析

2.1基本分析框架的选择

2.2方法原理

2.3分析结果

2.4讨论与小结

第三章人H3序列变异关键位点的数据挖掘分析

3.1基本分析框架的选择

3.2方法原理

3.3分析结果

3.4讨论与小结

第四章H3序列的进化树分析

4.1进化树分析方法的选择

4.2方法原理

4.3具体分析操作

4.4分析结果

4.5讨论与小结

第五章进化主干中正向选择位点的发现

5.1问题的提出

5.2方法原理

5.3分析结果

5.4讨论与小结

第六章研究总结

6.1主要内容与研究结论

6.2研究的创新点与特色

6.3进一步的研究方向

参考文献

附录 综述 分子进化树的构建方法

1.基本的模型结构

2.进化树的构建方法

3.树的可靠性评价与假设检验

4.进化树分析的软件实现

5.进化树计算方法的最新进展

参考文献

附录二博士期间论文发表情况

致谢

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