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介导含硫多肽类抗生素耐药的23S rRNA甲基转移酶的生化功能研究

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目录

摘要

Abstract

第一章 综述

1 细菌产生抗生素耐药性的机理

2 已知功能的RNA耐药型甲基转移酶

2.1 红霉素耐药性RNA甲基转移酶

2.2 卑霉素耐药性RNA甲基转移酶

2.3 rRNA Gm2270甲基转移酶

3 含硫多肽类抗生素及其耐药性产生机理

4 RNA甲基化的检测方法

4.1 引物延伸法

4.2 同位素标记后通过液闪仪检测

4.3 高效液相色谱与质谱联用

第二章 TSR、NHR的克隆、表达与纯化以及核糖体RNA底物的体外合成

1 材料

1.1 仪器

1.2 试剂

1.3 质粒与菌株

1.4 培养基及缓冲液

2 方法

2.1 TSR、NHR的克隆

2.2 TSR、NHR蛋白表达及纯化

2.3 蛋白浓度测定

2.4 核糖体RNA底物的体外合成

3 结果

3.1 TSR、NHR的克隆

3.2 TSR、NHR蛋白表达及纯化

3.3 两步法PCR扩增58bp RNA底物DNA模板

3.4 NHR与TSR比对结果及NHR蛋白的三维结构总览

4 本章小结

第三章 TSR、NHR的甲基转移酶活性

1 材料

1.1 仪器

1.2 试剂

1.3 缓冲液

2 方法

2.1 TSR及NHR蛋白最佳反应条件

2.2 甲基化位点A1067位突变研究

2.3 TSR、NHR蛋白对RNA底物的浓度依赖性

2.4 NHR蛋白突变体的甲基化能力

3 结果

3.1 TSR及NHR蛋白最佳反应条件

3.2 甲基化位点A1067位突变研究

3.3 TSR、NHR蛋白对RNA底物的浓度依赖性

3.4 NHR蛋白突变体的甲基化能力

4 本章小结

第四章 TSR、NHR蛋白与底物RNA的相互作用

1 材料

1.1 材料

1.2 试剂

1.3 缓冲液

2 方法

2.1 Gel shift检测TSR、NHR蛋白与RNA底物体外相互作用

2.2 Gel shift检测SAM对TSR、NHR蛋白与RNA底物体外相互作用的影响

2.3 TSR、NHR蛋白与RNA底物的亲和力测定

3 结果

3.1 Gel shift检测TSR、NHR蛋白与RNA底物体外相互作用

3.2 Gel shift检测SAM对TSR、NHR蛋白与RNA底物体外相互作用的影响

3.3 TSR、NHR蛋白与RNA底物的亲和力测定

4 本章小结

全文总结与展望

参考文献

致谢

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