2011-2013年上海地区儿童猩红热的病原学分子特征及其耐药性的监测研究

摘要

本文主要从以下几个部分展开论述：
　　第一部分 2002年-2013年上海地区猩红热的流行趋势及确诊病例的人群特征
　　目的:了解2002-2013年近12年来上海地区猩红热的流行趋势及病原学确诊病例的人口统计学特征。
　　方法:采集了2002年1月-2013年12月复旦大学附属儿科医院传染病门诊每月猩红热临床诊断病例数及病原学确诊病例数，采集病原学确诊病例的人口统计学资料。
　　结果:2002年1月-2013年12月我院传染病门诊临床诊断猩红热患儿病例数范围从151例/年（2003年）至4076例/年（2011年）。咽拭子培养结果GAS阳性的病原学确诊猩红热患儿病例数所占比例依次为21.8％(39/179)、27.8％(42/151)、33.9％(129/380)、35.2％(252/715)、47.1％(256/543)、43.6％(430/987)、42.7％(315/738)、41.5％(196/472)、54.2％(187/345)、44.3％(1805/4076)、46.3％(1136/2455)及47.0％(959/2038)。观察到3个流行高峰分别出现在2005年、2007年和2011年。2011年出现了猩红热的暴发流行，当年的发病数是往年的3至20倍。2011年后猩红热的流行强度仍然在比较高的水平。上海猩红热全年均有发病，流行高峰见于晚春至盛夏的4至6月份，11月至次年1月份的冬季可出现小幅度流行。12年间的流行季节性没有明显的差别。5746例病原学确诊猩红热病例中，男孩占59.5％-71.8％，女孩占28.2％-40.5％。常见发病年龄4-9岁，占86.8％(4990/5746)，绝大多数病例为幼托和学校机构儿童，占96.6％(5548/5746)。所有病例经过7-10天的抗生素治疗均临床治愈，未发生重症和死亡病例以及非化脓性并发症。
　　结论:2011年上海地区发生了前所未有的猩红热暴发流行。上海地区猩红热每年有两个流行高峰，主要的流行高峰为4至6月，11月至次年1月有小幅度流行。男性病例占多数，最常见的发病年龄4-9岁。
　　第二部分 2011-2013年流行高峰时期猩红热患者以及带菌者GAS分离株的分子特征
　　目的:主动监测上海地区2011年猩红热暴发流行当年及2012-2013年猩红热暴发流行后两年的来源于猩红热病人及无症状带菌者的GAS菌株的分子特征，动态观察猩红热儿童中流行的GAS菌株的emm型和超抗原的不同年度的分布情况。
　　方法:2011年-2013年猩红热流行的高峰月份（4至6月及11至12月）采集复旦大学附属儿科医院传染病门诊临床诊断猩红热病例的咽拭子标本，同时在5月及12月采集社区健康儿童及有猩红热病例发生学校的小学生的咽拭子标本，所有标本送上海市CDC参考实验室进行GAS培养分离。对纳入的菌株进行emm分型、超抗原的检测、PFGE分型以及MLST分型。
　　结果:总共760例猩红热患者中培养分离出384株GAS菌株(50.5％)，2011年6月在一所猩红热疫情暴发严重的小学校从30例无症状密切接触者中分离培养出13(43.3％)株GAS菌株。2012年-2013年从215例社区健康儿童的咽拭子标本中培养分离到23(10.7％)株GAS菌株。2011-2013年5月从492例无症状小学生咽拭子标本中培养分离出32株(6.5％) GAS菌株。2011年-2013年连续3年的12月份从360例无症状小学生的咽拭子标本中分离培养出8株(2.2％) GAS菌株。428株GAS菌株进行emm分型，共鉴定出6种emm分型，分别为emm1型、emm12型、emm3型、emm22型、emm75型及emm89型，其中来自猩红热病例的371株GAS中，emm12型(77.6％)最为常见，之后依次为emml型(20.5％)、emm75型(0.8％)、emm22型(0.5％)、emm3型(0.3％)、及emm89型(0.3％)，来自健康带菌者的57株GAS菌株中emm12型(86.0％)最为常见，其次emm1型(10.5％)、及emm75型(3.5％)。总体来说3年中以emm12型占优势。但2013年emm1型所占比例有所增加，在猩红热患者组及健康带菌者组中分别占36.1％及20.0％。279株猩红热病例的GAS菌株中检测到9种超抗原，包括speA(19.0％)、speC(87.1％)、speG(95.7％)、speH(54.5％)、speI(73.9％)、speJ(18.6％)、speL(0.4％)、ssa(90.0％)、及smeZ(77.0％)。PFGE聚类图显示绝大部分emm12型是克隆相关的。基于7个管家基因的等位基因谱的MLST分型显示，所有显示不同PFGE带型的emm12型及其亚型菌株均为ST36，emm1型GAS菌株均为ST28型，emm3型GAS菌株均为ST315型，emm22型GAS菌株均为ST46型，emm75型GAS菌株均为ST49型，emm89型GAS菌株均为ST101型。
　　结论:emm12型菌株导致2011年上海地区猩红热暴发流行，2012-2013年emm12型GAS菌株仍为优势流行株，大部分emm12型GAS菌株是克隆相关的。此外emm1型GAS菌株也是常见的流行株，而且2013年检出比例明显增多。在流行高峰时期，社区儿童和在校学龄儿童GAS携带感染值得关注，而且emm型分布与猩红热病例相似，可能对GAS在易感儿童中传播流行具有一定意义。
　　第三部分 上海地区化脓性链球菌的细菌耐药性监测
　　目的:监测GAS菌株的耐药性，以指导本地区GAS感染的合理抗生素治疗。
　　方法:对371株猩红热病例GAS菌株及57株健康带菌者GAS菌株进行纸片法药敏试验。
　　结果:所有菌株对青霉素G、氨苄西林、头孢吡肟/头孢噻肟、万古霉素、利奈唑胺和左氧氟沙星全部敏感。猩红热病例组371株GAS菌株对红霉素、阿奇霉素、克林霉素、、四环素的耐药率分别为98.9％、98.7％、98.7％和74.4％。健康带菌者组57株GAS菌株对红霉素、阿奇霉素、克林霉素、四环素的耐药率分别为94.7％、94.7％、96.5％和91.2％。此外，少部分GAS菌株对氯霉素耐药。
　　结论:上海地区流行的GAS菌株对β内酰胺类抗生素敏感，对大环内脂类抗生素及克林霉素耐药情况严峻。

目录

缩略语

摘要

前言

第一部分 2002年-2013年上海地区猩红热的流行趋势及确诊病例的人群特征

研究材料和方法

结果

讨论

第二部分 2011-2013年流行高峰时期猩红热患者以及带菌者GAS分离株的分子特征

研究材料和方法

结果

讨论

第三部分 上海地区化脓性链球菌的细菌耐药性监测

研究材料和方法

结果

讨论

结论

创新性

参考文献

附录

致谢

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