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【6h】

基于GEO数据库的差异表达基因分析系统的构建

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Abstract

1引 言

1.1问题的提出与研究意义

1.1.1问题的提出

1.1.2研究意义

1.2国内外相关研究综述

1.2.1GEO数据库研究现状

1.2.2基因芯片技术研究现状

1.2.3差异表达基因分析研究现状及意义

1.3研究目标及创新点

1.3.1研究目标

1.3.2论文创新点

1.4数据来源

1.5论文框架

2相关理论与技术基础

2.1基因芯片与基因表达谱

2.2Python编程语言及其扩展包

2.2.1Python-NumPy和Python-SciPy

2.2.2Python-Pandas

2.2.3Python-Tarfile

2.2.4Python-Lxml

2.3MySQL数据库

2.4T-test统计学模型

2.5小结

3差异表达基因分析系统的总体需求

3.1差异表达基因分析系统的功能需求

3.1.1高效性和准确性

3.1.2标准化和兼容性

3.1.3可扩展性和跨平台性

3.1.4文件解压缩和合并处理功能

3.2差异表达基因分析系统的业务需求

3.3小结

4差异表达基因分析系统的总体设计

4.1差异表达基因分析系统的总体构架

4.2差异表达基因分析系统的模块设计

4.3小结

5差异表达基因分析系统的实现与运行

5.1数据的标准化处理模块

5.1.1算法实现过程

5.1.2运行和分析

5.2矩阵的生成和分组设计模块

5.2.1算法实现过程

5.2.2运行和分析

5.3差异表达基因分析模块

5.3.1算法实现过程

5.3.2运行和分析

5.4小结

6总结与展望

6.1研究结论

6.2不足与展望

参考文献:

致 谢

在学期间承担/参与的科研课题和所取得的科研成果

个人简历

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著录项

  • 作者

    张阁;

  • 作者单位

    山西医科大学;

  • 授予单位 山西医科大学;
  • 学科 公共卫生
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 贺培凤,于琦;
  • 年度 2018
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类
  • 关键词

    数据库; 差异表达; 基因分析系统;

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