盾纤亚纲（纤毛门，寡膜纲）纤毛虫的分子系统学研究

摘要

盾纤亚纲隶属于纤毛门寡膜纲,为一大类广泛分布于各种水体,尤其是富营养的养殖水体的单细胞原生动物.因其形体微小,种类间形态结构相似,而成为分类和系统学研究中极为混乱的类群之一.该研究选用了随机扩增多态性DNA(RAPD)、限制性酶切多样性(RFLP)和核糖体不同基因测序分析,研究了盾纤类纤毛虫相近种、种群间区分及这一亚纲下诸多分类阶元间的系统发生关系,同时对于不同分子标记方法和不同分析方法在纤毛虫分类和系统学研究中的应用做了较为详尽的探讨.利用RAPD及RAPD/RFLP方法分析了盾纤类种群间、形近种间,相近属及较远属和属上阶元之遗传距离,结果表明RAPD方法在种下、种间的区分及其遗传距离揭示中有良好的应用;而RFLP酶切图谱具有种特异性,可用于形近种区分和遗传关系分析.该研究首次完成了9种10个种群盾纤类纤毛虫之小亚基单位核糖体RNA(SSrRNA)基因全序列的测定,占这一在分子生物学研究较少的门类中迄今超过半数的序列数;同时测定了8种9个种群的核糖体5.8SRNA基因序列及转录间隔区ITS1和ITS2序列.根据上述4个不同序列分析,采用距离法(LS,NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)分析了盾纤亚纲纤毛虫的系统发生.该工作分析在分子水平上确认了.1、盾纤亚纲为一单元发生系,在寡膜纲中,与膜口亚纲有着较近的进化关系.2、盾纤亚纲内嗜污目(根据Lynn&Small 1997)为一单元发生系,帆口目种类与之分开.3、尾丝虫属和拟尾丝虫属均非单元发生系,其种类在系统中形成与形态学不同的进化关系.4、形态相近的拟阿脑虫属、异阿脑虫属和后阿脑虫属确有较近的系统关系.5、Corliss(1979)系统中关于康纤虫科和嗜污科划分不成立.6、庞氏类右毛虫为盾纤亚纲内一

目录

摘要

Abstract

材料与方法

第一章 前言

1. 盾纤亚纲纤毛虫系统学研究概况

2. 分子技术在纤毛虫系统分类学中的应用

3. 本工作的主要内容、意义及前景

参考文献

第二章利用RAPD，RFLP技术对盾纤类纤毛虫的种类区分和系统关系探讨

第一节 利用RAPD技术对海洋纤毛虫，弗州拟尾丝虫四种群的研究

第二节 利用RAPD/RFLP技术对三种盾纤类纤毛虫的研究

第三节 用RAPD技术对10种盾纤亚纲纤毛虫遗传关系探讨

第四节 RAPD和RFLP技术盾纤类纤毛虫种上水平系统分类中的应用探讨

参考文献

第三章 基于小亚基核糖体(SSrRNA)基因序列分析的盾纤亚纲纤毛虫分子系统学

第一节 两种盾纤亚纲纤毛虫，巨大拟阿脑虫和蟹栖异阿脑虫(纤毛门，寡膜纲)的系统地位探讨

第二节 两种盾纤亚纲纤毛虫，相似后阿脑虫和哈氏伪康纤虫(纤毛门，寡膜纲)的系统地位探讨

第三节 基于SSrRNA序列分析的盾纤亚纲纤毛虫的系统分类研究及若干属种的系统地位探讨

参考文献

第四章5.8S核糖体基因及转录间隔序列ITS1，ITS2在盾纤亚纲纤毛虫分子系统学中的应用

第一节 盾纤类纤毛虫5.8S核糖体基因及转录间隔序列(ITS1,ITS2)的保守性和变异度分析

第二节 利用ITS1-5.8S-ITS2序列对盾纤亚纲纤毛虫的分子系统学研究

参考文献

附录1 本研究所测定之SSrRNA基因序列

附录2 本研究所测定之5.8S基因序列

附录3 博士就读期间发表和已整理的文章（SC/EI标记为*）

致谢