杂交扇贝（栉孔扇贝Chlamys farreri♀×华贵栉孔扇贝C.nobilis♂）数量性状和刺参（Apostichopus japonicus）ISSR标记研究

摘要

在目前的水产养殖中，种质已越来越成为发展养殖业亟需解决的关键问题。而近几年迅速发展起来的分子标记技术为其育种工作提供了新的有力手段。本论文即应用分子标记技术中的几种对杂交扇贝和海参中的刺参的遗传育种中遇到的有关问题从分子水平上进行了的探讨，为将分子标记辅助育种技术应用于水产养殖提供借鉴。本论文主要内容包括两部分，第一部分利用相关分析、回归检测、单因素方差分析等生物统计手段，分析了杂交扇贝数量性状之间以及数量性状与AFLP分子标记之间的相关关系；第二部分利用ISSR分子标记技术分析了黄渤海两群海参群体内部和群体之间的遗传多样性。主要结果如下： 1.选取52只一龄杂交扇贝，测定其壳长、壳宽、壳高、总重、软体重并计算相关系数，采用通径分析方法计算了以贝壳性状为自变量对软体重作依变量的通径系数、决定系数及相关指数。结果表明，栉孔华贵扇贝壳长、壳宽、壳高与总重、软体重的相关系数均达到极显著水平；壳高对活体重的直接影响最大，代表直接影响的通径系数达到0.6749，是影响活体重的主要因素；壳长与活体重的相关程度很大，但对活体重的直接影响较小，其通径系数为0.2120，主要通过壳高间接影响活体重，是影响软体重的次要因素；壳宽对软体重的直接影响最小，通径系数为0.0900；决定系数分析结果与通径分析结果有一致的变化趋势；所选贝壳性状与软体重的复相关指数为R2=0.8219；多元回归分析建立了壳长、壳宽、壳高估计软体重的回归方程为：Y=-38.7074+2.1427X1+2.1517X2+7.2214X3，为扇贝选种提供了理论依据和测度指标。 2.选取40只一龄杂交扇贝，测定其壳长、壳宽、壳高、总重、软体重等数量性状，应用AFLP分子标记技术检测与该群体3个数量性状(软体重、高、长)相关的遗传标记(QTLs)，该群体中数量性状值的分布基本符合正态分布。单因子方差分析检测出于软体重、高、长相关的37、37、35个标记座位，并计算了个标记对相关性状变异的贡献率。t检验结果表明，各标记显带型和不显带型组性状均值的差异显著或极显著，并对有带无带两组的数量性状均值进行了对比。对位点一致性的比较表明，软体重与贝壳高共同对应的相关位点其相似性无论从位点有无还是相关程度都高于软体重与贝壳长共同对应的位点；且绝大多数位点都共同影响三个数量性状值，为以后的QTL定位提供了基础信息。 3.使用了10个ISSR引物对分别取自黄海和渤海的刺参群体进行PCR扩增，在两个群体中扩增了较高的多态性。一共扩增出64个位点，大小从300bp到1500bp不等，平均每个引物扩增出6.4条带。在57个个体当中，多态性位点比率为92.19％。其中，蓬莱群体(PL)和青岛群体(QD)的多态性位点比率分别是81.25％和82.81％。在蓬莱和青岛两个群体中，平均等位基因位点的观察值(Ao)分别为1.81和1.83，Nei's的平均基因多样性指数(He)分别为0.36和0.34,香农指数的平均值(I)分别为0.52和0.50；在两个群体之间，两个群体之间的遗传差异指数(Gst)是0.073，Nei's的平均基因多样性指数(He)以及香农指数的平均值(I)分别为0.3789和0.5504。群体间的遗传相似度(I)达到0.9235，遗传距离(D)只有0.0796。说明这两群刺参的遗传多样性比较高。根据遗传距离使用UPGMA法通过PHYLIP软件构建了两个群体内个体间的系统树。

目录

摘要

第一章文献综述

一、海产经济贝类杂交育种现状和扇贝的杂交育种进展

1贝类杂交育种进展现状

2扇贝的杂交育种进展

二、分子标记技术的发展概况

1分子标记简介

2分子标记技术在贝类育种研究中的几方面应用

3应用前景

第二章栉孔华贵杂交扇贝壳尺寸性状对软体重的影响效果分析

0引言

1材料与方法

2结果

3讨论

第三章栉孔华贵杂交扇贝数量性状与AFLP的相关性分析

0引言

1材料与方法

2实验结果与分析

3讨论

第四章黄渤海两个刺参群体遗传多样性的ISSR分析

0引言

1材料与方法

2实验结果

3讨论

参考文献

致谢